Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEFHP12036 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFHP12036 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFHP12036 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFHP12036 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFHP12036 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFHP12036 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFHP12036 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFHP12036 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFHP12036 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFHP12036 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFHP12036 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFHP12036 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFHP12036 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFHP12036 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFHP12036 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFHP12036 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFHP12036 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFHP12036 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFHP12036 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFHP12036 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NEFHP12036 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFHP12036 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFHP12036 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFHP12036 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFHP12036 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFHP12036 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFHP12036 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFHP12036 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFHP12036 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFHP12036 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFHP12036 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFHP12036 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFHP12036 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFHP12036 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFHP12036 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFHP12036 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFHP12036 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFHP12036 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFHP12036 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFHP12036 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFHP12036 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFHP12036 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFHP12036 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFHP12036 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFHP12036 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFHP12036 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFHP12036 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEFHP12036 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEFHP12036 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEFHP12036 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEFHP12036 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEFHP12036 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEFHP12036 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEFHP12036 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEFHP12036 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEFHP12036 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEFHP12036 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEFHP12036 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEFHP12036 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEFHP12036 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NEFHP12036 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEFHP12036 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEFHP12036 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEFHP12036 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEFHP12036 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEFHP12036 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEFHP12036 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEFHP12036 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEFHP12036 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEFHP12036 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEFHP12036 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEFHP12036 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEFHP12036 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEFHP12036 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEFHP12036 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEFHP12036 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEFHP12036 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NEFHP12036 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEFHP12036 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEFHP12036 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEFHP12036 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEFHP12036 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEFHP12036 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEFHP12036 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEFHP12036 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEFHP12036 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEFHP12036 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEFHP12036 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEFHP12036 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEFHP12036 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEFHP12036 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEFHP12036 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEFHP12036 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEFHP12036 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NEFHP12036 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEFHP12036 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEFHP12036 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEFHP12036 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEFHP12036 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms