Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms