Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND30

PPFIBP2, Liprin-beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP2Q8ND30 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIBP2Q8ND30 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms