Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms