Protein–RNA interactions for Protein: P14314

PRKCSH, Glucosidase 2 subunit beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCSHP14314 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCSHP14314 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCSHP14314 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCSHP14314 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCSHP14314 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCSHP14314 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCSHP14314 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCSHP14314 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCSHP14314 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCSHP14314 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCSHP14314 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCSHP14314 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCSHP14314 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCSHP14314 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCSHP14314 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCSHP14314 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCSHP14314 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCSHP14314 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCSHP14314 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCSHP14314 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCSHP14314 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCSHP14314 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCSHP14314 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCSHP14314 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCSHP14314 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCSHP14314 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCSHP14314 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms