Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRQ5

SMCO4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO4Q9NRQ5 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO4Q9NRQ5 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO4Q9NRQ5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO4Q9NRQ5 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO4Q9NRQ5 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO4Q9NRQ5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO4Q9NRQ5 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO4Q9NRQ5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO4Q9NRQ5 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO4Q9NRQ5 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO4Q9NRQ5 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO4Q9NRQ5 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO4Q9NRQ5 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO4Q9NRQ5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO4Q9NRQ5 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO4Q9NRQ5 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMCO4Q9NRQ5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMCO4Q9NRQ5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMCO4Q9NRQ5 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMCO4Q9NRQ5 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMCO4Q9NRQ5 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMCO4Q9NRQ5 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMCO4Q9NRQ5 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMCO4Q9NRQ5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMCO4Q9NRQ5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMCO4Q9NRQ5 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO4Q9NRQ5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms