Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ95

ECSIT, Evolutionarily conserved signaling intermediate in Toll pathway, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECSITQ9BQ95 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ECSITQ9BQ95 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ECSITQ9BQ95 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ECSITQ9BQ95 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ECSITQ9BQ95 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ECSITQ9BQ95 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms