Protein–RNA interactions for Protein: Q96M42

LINC00479, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00479, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00479Q96M42 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00479Q96M42 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00479Q96M42 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms