Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKNOX2Q96KN3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.4 ms