Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
PKNOX2Q96KN3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37.25■■■■□ 3.55
PKNOX2Q96KN3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PKNOX2Q96KN3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PKNOX2Q96KN3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PKNOX2Q96KN3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PKNOX2Q96KN3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
PKNOX2Q96KN3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PKNOX2Q96KN3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PKNOX2Q96KN3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PKNOX2Q96KN3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PKNOX2Q96KN3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
PKNOX2Q96KN3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PKNOX2Q96KN3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PKNOX2Q96KN3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PKNOX2Q96KN3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PKNOX2Q96KN3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PKNOX2Q96KN3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PKNOX2Q96KN3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PKNOX2Q96KN3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PKNOX2Q96KN3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PKNOX2Q96KN3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
PKNOX2Q96KN3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PKNOX2Q96KN3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PKNOX2Q96KN3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PKNOX2Q96KN3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
PKNOX2Q96KN3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PKNOX2Q96KN3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PKNOX2Q96KN3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
PKNOX2Q96KN3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PKNOX2Q96KN3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PKNOX2Q96KN3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PKNOX2Q96KN3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PKNOX2Q96KN3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PKNOX2Q96KN3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PKNOX2Q96KN3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PKNOX2Q96KN3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PKNOX2Q96KN3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PKNOX2Q96KN3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PKNOX2Q96KN3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PKNOX2Q96KN3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PKNOX2Q96KN3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
PKNOX2Q96KN3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PKNOX2Q96KN3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PKNOX2Q96KN3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PKNOX2Q96KN3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PKNOX2Q96KN3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PKNOX2Q96KN3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PKNOX2Q96KN3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PKNOX2Q96KN3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PKNOX2Q96KN3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PKNOX2Q96KN3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PKNOX2Q96KN3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
PKNOX2Q96KN3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PKNOX2Q96KN3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PKNOX2Q96KN3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PKNOX2Q96KN3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PKNOX2Q96KN3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PKNOX2Q96KN3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PKNOX2Q96KN3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PKNOX2Q96KN3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PKNOX2Q96KN3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PKNOX2Q96KN3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PKNOX2Q96KN3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PKNOX2Q96KN3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PKNOX2Q96KN3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PKNOX2Q96KN3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PKNOX2Q96KN3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PKNOX2Q96KN3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PKNOX2Q96KN3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PKNOX2Q96KN3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PKNOX2Q96KN3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PKNOX2Q96KN3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PKNOX2Q96KN3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
PKNOX2Q96KN3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PKNOX2Q96KN3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PKNOX2Q96KN3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PKNOX2Q96KN3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PKNOX2Q96KN3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PKNOX2Q96KN3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PKNOX2Q96KN3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PKNOX2Q96KN3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PKNOX2Q96KN3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PKNOX2Q96KN3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PKNOX2Q96KN3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PKNOX2Q96KN3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PKNOX2Q96KN3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PKNOX2Q96KN3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PKNOX2Q96KN3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PKNOX2Q96KN3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PKNOX2Q96KN3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PKNOX2Q96KN3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PKNOX2Q96KN3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PKNOX2Q96KN3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PKNOX2Q96KN3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PKNOX2Q96KN3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PKNOX2Q96KN3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PKNOX2Q96KN3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PKNOX2Q96KN3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PKNOX2Q96KN3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms