Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATRAIDQ6UW56 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATRAIDQ6UW56 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms