Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNCBQ16143 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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