Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.241e-8■■■■■ 41
EFTUD2Q15029 PCBP4-215ENST00000492809 2599 ntTSL 215.5■□□□□ 0.071e-8■■■■■ 41
EFTUD2Q15029 KRT19-205ENST00000471565 654 ntTSL 216.4■□□□□ 0.222e-6■■■■■ 41
EFTUD2Q15029 KRT19-204ENST00000468880 868 ntTSL 214.2□□□□□ -0.142e-6■■■■■ 41
EFTUD2Q15029 AC008763.2-202ENST00000599243 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 417.74■□□□□ 0.431e-6■■■■■ 41
EFTUD2Q15029 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.295e-7■■■■■ 41
EFTUD2Q15029 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.135e-7■■■■■ 41
EFTUD2Q15029 CST3-203ENST00000398411 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.225e-7■■■■■ 41
EFTUD2Q15029 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.515e-6■■■■■ 40.9
EFTUD2Q15029 SIN3A-212ENST00000568919 455 ntTSL 217.14■□□□□ 0.335e-6■■■■■ 40.9
EFTUD2Q15029 SIN3A-206ENST00000565264 510 ntTSL 415.29■□□□□ 0.045e-6■■■■■ 40.9
EFTUD2Q15029 SIN3A-202ENST00000394947 6737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.315e-6■■■■■ 40.9
EFTUD2Q15029 SIN3A-208ENST00000567289 4078 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.455e-6■■■■■ 40.9
EFTUD2Q15029 SIN3A-204ENST00000562776 590 ntTSL 410.42□□□□□ -0.745e-6■■■■■ 40.9
EFTUD2Q15029 SIN3A-214ENST00000570115 554 ntTSL 410.26□□□□□ -0.775e-6■■■■■ 40.9
EFTUD2Q15029 SIN3A-201ENST00000360439 5050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.795e-6■■■■■ 40.9
EFTUD2Q15029 SIN3A-205ENST00000564778 617 ntTSL 29.81□□□□□ -0.845e-6■■■■■ 40.9
EFTUD2Q15029 KIZ-204ENST00000451772 536 ntTSL 38.8□□□□□ -15e-6■■■■■ 40.9
EFTUD2Q15029 SIN3A-209ENST00000568190 567 ntTSL 48.05□□□□□ -1.125e-6■■■■■ 40.9
EFTUD2Q15029 KIZ-207ENST00000616679 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 57.97□□□□□ -1.135e-6■■■■■ 40.9
EFTUD2Q15029 SIN3A-210ENST00000568309 549 ntTSL 47.05□□□□□ -1.285e-6■■■■■ 40.9
EFTUD2Q15029 SIN3A-211ENST00000568431 565 ntTSL 56.78□□□□□ -1.325e-6■■■■■ 40.9
EFTUD2Q15029 KIZ-214ENST00000621366 1397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)3.66□□□□□ -1.825e-6■■■■■ 40.9
EFTUD2Q15029 KIZ-203ENST00000441136 442 ntTSL 33.48□□□□□ -1.855e-6■■■■■ 40.9
EFTUD2Q15029 KIZ-209ENST00000619179 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 53.43□□□□□ -1.865e-6■■■■■ 40.9
EFTUD2Q15029 KIZ-201ENST00000419359 517 ntTSL 22.96□□□□□ -1.945e-6■■■■■ 40.9
EFTUD2Q15029 MINK1-204ENST00000571207 4569 ntTSL 516.02■□□□□ 0.161e-6■■■■■ 40.9
EFTUD2Q15029 ARHGEF1-217ENST00000598812 588 ntTSL 518.57■□□□□ 0.564e-7■■■■■ 40.9
EFTUD2Q15029 TAF4-204ENST00000486599 412 ntTSL 214.24□□□□□ -0.135e-8■■■■■ 40.9
EFTUD2Q15029 NAPG-205ENST00000582472 694 ntTSL 59.66□□□□□ -0.864e-7■■■■■ 40.9
EFTUD2Q15029 HNRNPU-220ENST00000639667 3940 ntTSL 25.73□□□□□ -1.497e-14■■■■■ 40.9
EFTUD2Q15029 EEF1G-202ENST00000524420 557 ntTSL 411.05□□□□□ -0.644e-10■■■■■ 40.9
EFTUD2Q15029 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.12e-22■■■■■ 40.9
EFTUD2Q15029 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.422e-22■■■■■ 40.9
EFTUD2Q15029 EIF3K-213ENST00000593149 760 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.622e-22■■■■■ 40.9
EFTUD2Q15029 EIF3K-214ENST00000614624 780 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.782e-22■■■■■ 40.9
EFTUD2Q15029 EIF3K-208ENST00000588934 501 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.92e-22■■■■■ 40.9
EFTUD2Q15029 EIF3K-201ENST00000248342 864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.952e-22■■■■■ 40.9
EFTUD2Q15029 EIF3K-211ENST00000592558 670 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.992e-22■■■■■ 40.9
EFTUD2Q15029 EIF3K-209ENST00000590134 711 ntTSL 28.06□□□□□ -1.122e-22■■■■■ 40.9
EFTUD2Q15029 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.291e-6■■■■■ 40.9
EFTUD2Q15029 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.051e-6■■■■■ 40.9
EFTUD2Q15029 CC2D1B-209ENST00000491136 4335 ntTSL 1 (best)10.93□□□□□ -0.661e-6■■■■■ 40.9
EFTUD2Q15029 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.67□□□□□ -2.145e-40■■■■■ 40.9
EFTUD2Q15029 TNPO2-213ENST00000589149 564 ntTSL 514.4□□□□□ -0.16e-8■■■■■ 40.9
EFTUD2Q15029 C1orf159-211ENST00000465822 1933 ntTSL 216.38■□□□□ 0.211e-6■■■■■ 40.8
EFTUD2Q15029 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.111e-6■■■■■ 40.8
EFTUD2Q15029 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.241e-6■■■■■ 40.8
EFTUD2Q15029 HSPA8-211ENST00000527983 1509 ntTSL 1 (best)11.66□□□□□ -0.541e-12■■■■■ 40.8
EFTUD2Q15029 HSPA8-220ENST00000533238 465 ntTSL 36.15□□□□□ -1.421e-12■■■■■ 40.8
EFTUD2Q15029 CDT1-202ENST00000562747 735 ntTSL 215.85■□□□□ 0.135e-7■■■■■ 40.8
EFTUD2Q15029 PRODH2-206ENST00000591694 728 ntTSL 316.54■□□□□ 0.242e-20■■■■■ 40.8
EFTUD2Q15029 NDOR1-206ENST00000613750 1151 ntTSL 314.69□□□□□ -0.061e-7■■■■■ 40.8
EFTUD2Q15029 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.449e-7■■■■■ 40.8
EFTUD2Q15029 PTS-209ENST00000531673 986 ntTSL 1 (best)13.49□□□□□ -0.259e-7■■■■■ 40.8
EFTUD2Q15029 PTS-207ENST00000528679 846 ntTSL 211.42□□□□□ -0.589e-7■■■■■ 40.8
EFTUD2Q15029 PTS-204ENST00000525803 625 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.689e-7■■■■■ 40.8
EFTUD2Q15029 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.121e-6■■■■■ 40.8
EFTUD2Q15029 SLC39A4-208ENST00000531789 361 ntTSL 311.99□□□□□ -0.493e-11■■■■■ 40.7
EFTUD2Q15029 CCNF-201ENST00000293968 4173 ntTSL 1 (best)15.55■□□□□ 0.082e-7■■■■■ 40.7
EFTUD2Q15029 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.072e-7■■■■■ 40.7
EFTUD2Q15029 DVL1-203ENST00000472445 639 ntTSL 216.9■□□□□ 0.36e-7■■■■■ 40.7
EFTUD2Q15029 WNK2-206ENST00000448039 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)22.51■■□□□ 1.192e-7■■■■■ 40.7
EFTUD2Q15029 RECQL4-205ENST00000532846 1055 ntTSL 517.03■□□□□ 0.325e-9■■■■■ 40.7
EFTUD2Q15029 PCBP2-208ENST00000546652 823 ntTSL 510.73□□□□□ -0.692e-8■■■■■ 40.7
EFTUD2Q15029 CENPT-209ENST00000562947 797 ntTSL 311.16□□□□□ -0.627e-10■■■■■ 40.7
EFTUD2Q15029 GALE-206ENST00000456977 672 ntTSL 211.41□□□□□ -0.581e-7■■■■■ 40.7
EFTUD2Q15029 MTA1-217ENST00000550551 416 ntTSL 318.95■□□□□ 0.629e-7■■■■■ 40.7
EFTUD2Q15029 POLR1C-204ENST00000423780 418 ntTSL 512.3□□□□□ -0.448e-7■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 POLR1C-205ENST00000428025 576 ntTSL 42.26□□□□□ -2.058e-7■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 NCAPH2-207ENST00000520297 539 ntTSL 515.27■□□□□ 0.042e-8■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 ZWILCH-203ENST00000535141 2206 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.156e-7■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 ZWILCH-209ENST00000565627 1845 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.266e-7■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 ZWILCH-202ENST00000446801 3256 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.486e-7■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 ZWILCH-214ENST00000613446 3181 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.566e-7■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 ZWILCH-201ENST00000307897 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.786e-7■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 ZWILCH-212ENST00000567926 621 ntTSL 58.98□□□□□ -0.976e-7■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 ZWILCH-207ENST00000564179 582 ntTSL 58.98□□□□□ -0.976e-7■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 ZWILCH-210ENST00000565960 583 ntTSL 36.94□□□□□ -1.36e-7■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 ZWILCH-206ENST00000563698 567 ntTSL 45.75□□□□□ -1.496e-7■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 LRRC45-204ENST00000582083 527 ntTSL 315.19■□□□□ 0.022e-6■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 PPAN-203ENST00000430370 594 ntTSL 311.53□□□□□ -0.561e-9■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 IMP4-213ENST00000473689 877 ntTSL 519.22■□□□□ 0.678e-7■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 IMP4-216ENST00000490895 776 ntTSL 314.33□□□□□ -0.128e-7■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 INTS11-232ENST00000526904 551 ntTSL 415.86■□□□□ 0.133e-12■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 PER1-204ENST00000577424 626 ntTSL 312.37□□□□□ -0.435e-8■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.292e-9■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.252e-9■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.132e-9■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 C19orf12-203ENST00000392275 1188 ntTSL 221.93■■□□□ 1.12e-9■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.062e-9■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.062e-9■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.852e-9■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.812e-9■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.692e-9■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 C19orf12-202ENST00000342680 578 ntTSL 518.78■□□□□ 0.62e-9■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 HAAO-206ENST00000406924 1103 ntTSL 218.59■□□□□ 0.575e-18■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.542e-9■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 SNHG11-203ENST00000418383 819 ntTSL 318.28■□□□□ 0.522e-9■■■■■ 40.6
EFTUD2Q15029 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.362e-9■■■■■ 40.6
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