Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARFIP2P53365 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARFIP2P53365 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARFIP2P53365 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARFIP2P53365 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARFIP2P53365 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARFIP2P53365 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARFIP2P53365 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARFIP2P53365 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARFIP2P53365 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARFIP2P53365 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARFIP2P53365 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARFIP2P53365 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARFIP2P53365 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms