Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SH3GL2Q99962 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms