Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
FAM3AP98173 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAM3AP98173 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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