Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD34P28906 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD34P28906 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD34P28906 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD34P28906 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD34P28906 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD34P28906 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD34P28906 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD34P28906 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD34P28906 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD34P28906 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD34P28906 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD34P28906 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD34P28906 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD34P28906 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD34P28906 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD34P28906 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD34P28906 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD34P28906 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD34P28906 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD34P28906 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD34P28906 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD34P28906 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD34P28906 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD34P28906 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD34P28906 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CD34P28906 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD34P28906 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD34P28906 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD34P28906 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD34P28906 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD34P28906 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD34P28906 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD34P28906 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD34P28906 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD34P28906 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD34P28906 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD34P28906 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CD34P28906 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD34P28906 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD34P28906 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CD34P28906 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD34P28906 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD34P28906 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD34P28906 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD34P28906 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD34P28906 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD34P28906 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD34P28906 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD34P28906 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD34P28906 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD34P28906 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD34P28906 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD34P28906 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CD34P28906 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD34P28906 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CD34P28906 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD34P28906 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CD34P28906 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD34P28906 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD34P28906 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD34P28906 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD34P28906 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD34P28906 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD34P28906 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD34P28906 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD34P28906 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD34P28906 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD34P28906 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD34P28906 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD34P28906 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD34P28906 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD34P28906 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD34P28906 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD34P28906 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD34P28906 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD34P28906 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD34P28906 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD34P28906 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD34P28906 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD34P28906 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD34P28906 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD34P28906 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD34P28906 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD34P28906 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CD34P28906 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD34P28906 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD34P28906 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD34P28906 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD34P28906 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD34P28906 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD34P28906 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD34P28906 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD34P28906 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD34P28906 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD34P28906 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CD34P28906 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD34P28906 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD34P28906 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD34P28906 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms