Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB5AP20339 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms