Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.023e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.018e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 CEP152-209ENST00000560322 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)15.03■□□□□ -03e-8■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 SLC25A10-206ENST00000573246 898 ntTSL 315.03■□□□□ -02e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 MPPE1-228ENST00000592894 1165 ntTSL 515.01□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 RNF216-203ENST00000411812 563 ntTSL 514.99□□□□□ -0.018e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 CLN6-215ENST00000636674 2005 ntTSL 514.96□□□□□ -0.018e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 PPHLN1-218ENST00000551723 415 ntTSL 514.92□□□□□ -0.023e-8■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 FANCA-226ENST00000567879 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 314.92□□□□□ -0.028e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 MPPE1-229ENST00000592977 1089 ntTSL 514.73□□□□□ -0.052e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 MPPE1-205ENST00000496196 2427 ntTSL 1 (best)14.66□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 TARS2-201ENST00000369051 2106 ntTSL 514.59□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 ODF2-212ENST00000446274 822 ntTSL 214.58□□□□□ -0.088e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.083e-8■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.083e-8■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 RNF157-208ENST00000592869 558 ntTSL 414.54□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 MC1R-201ENST00000539976 2464 ntTSL 514.5□□□□□ -0.096e-13■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.117e-8■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 RAI1-203ENST00000471135 570 ntTSL 314.35□□□□□ -0.111e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 MBOAT7-208ENST00000453320 557 ntTSL 414.3□□□□□ -0.128e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 AC073111.4-201ENST00000483664 582 ntTSL 414.2□□□□□ -0.148e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 CDK4-203ENST00000546489 776 ntTSL 514.18□□□□□ -0.148e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 CDK4-212ENST00000552388 694 ntTSL 314.18□□□□□ -0.148e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.141e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 MPPE1-217ENST00000589731 1568 ntTSL 1 (best)14.15□□□□□ -0.142e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 RNF216-204ENST00000416985 570 ntTSL 514.09□□□□□ -0.158e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 TARS2-205ENST00000438568 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.162e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.168e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 SH2D3A-208ENST00000599563 845 ntTSL 314.01□□□□□ -0.176e-13■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 MPPE1-204ENST00000344987 1831 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 155.1
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SF3B1O75533 CDK4-214ENST00000552862 447 ntTSL 313.86□□□□□ -0.198e-9■■■■■ 155.1
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SF3B1O75533 TARS2-214ENST00000606933 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 AC025171.1-201ENST00000314957 2388 ntTSL 1 (best)13.71□□□□□ -0.226e-13■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.222e-7■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 GOSR1-205ENST00000467337 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.236e-13■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 CLN6-225ENST00000638144 576 ntTSL 513.63□□□□□ -0.238e-9■■■■■ 155.1
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SF3B1O75533 MPPE1-202ENST00000317235 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.262e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.278e-9■■■■■ 155.1
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SF3B1O75533 FANCA-208ENST00000561722 696 ntTSL 313.37□□□□□ -0.278e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.282e-7■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.37e-8■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 MED28-203ENST00000503945 879 ntTSL 1 (best)13.13□□□□□ -0.318e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.318e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.332e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 MST1R-213ENST00000612032 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.332e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 FANCA-231ENST00000568626 727 ntTSL 312.92□□□□□ -0.348e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 MST1R-215ENST00000621387 4449 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.352e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 MST1R-208ENST00000468525 2727 ntTSL 1 (best)12.83□□□□□ -0.362e-6■■■■■ 155.1
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SF3B1O75533 DLST-210ENST00000555492 569 ntTSL 312.79□□□□□ -0.368e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 FANCA-215ENST00000564475 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 212.67□□□□□ -0.388e-9■■■■■ 155.1
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SF3B1O75533 NBN-203ENST00000409330 4523 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.392e-6■■■■■ 155.1
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SF3B1O75533 MPPE1-226ENST00000592447 2530 ntTSL 1 (best)12.54□□□□□ -0.42e-6■■■■■ 155.1
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SF3B1O75533 MICAL2-201ENST00000256194 3906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.425e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 NXF1-202ENST00000525576 572 ntTSL 412.4□□□□□ -0.426e-13■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 PPP1R26-AS1-201ENST00000455039 643 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.436e-13■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 ZNRD1ASP-219ENST00000448093 2296 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.438e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 MST1R-203ENST00000411578 4683 ntTSL 512.16□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 SH2D3A-206ENST00000597254 586 ntTSL 412.15□□□□□ -0.466e-13■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 PPHLN1-205ENST00000395568 2170 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.473e-8■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 TARS2-204ENST00000369064 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.482e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 FANCA-217ENST00000564969 850 ntTSL 312.05□□□□□ -0.488e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 PLEKHA2-201ENST00000518070 589 ntTSL 312.05□□□□□ -0.486e-13■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 IL10RB-206ENST00000609556 1341 ntTSL 511.95□□□□□ -0.57e-8■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 GOSR1-202ENST00000414833 947 ntTSL 311.94□□□□□ -0.56e-13■■■■■ 155.1
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SF3B1O75533 DLST-215ENST00000557012 698 ntTSL 211.7□□□□□ -0.548e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 DLST-212ENST00000556190 565 ntTSL 411.7□□□□□ -0.548e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 DLST-201ENST00000238671 1464 ntTSL 211.62□□□□□ -0.558e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 ZNRD1ASP-212ENST00000420251 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.578e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 MNT-209ENST00000575402 2813 nt11.5□□□□□ -0.576e-13■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 NBN-202ENST00000396252 4907 ntTSL 511.49□□□□□ -0.572e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 XYLT2-204ENST00000509778 145 ntTSL 311.47□□□□□ -0.571e-10■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 DLST-202ENST00000334220 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.578e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 FANCA-216ENST00000564870 460 ntTSL 311.38□□□□□ -0.598e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 MST1R-202ENST00000344206 4198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.642e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 LINC00843-202ENST00000444438 550 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.642e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 DLST-209ENST00000555459 567 ntTSL 410.89□□□□□ -0.678e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 DLST-208ENST00000555190 803 ntTSL 410.89□□□□□ -0.678e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 DMD-209ENST00000378702 2617 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.682e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 HERC4-207ENST00000460168 2215 ntTSL 210.74□□□□□ -0.698e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 PPP2R1A-208ENST00000473820 646 ntTSL 210.72□□□□□ -0.696e-13■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 DLST-206ENST00000555071 1365 ntTSL 210.72□□□□□ -0.698e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 DLST-214ENST00000556582 568 ntTSL 310.65□□□□□ -0.78e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 PPHLN1-224ENST00000613154 1863 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.713e-8■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 CBX5-202ENST00000439541 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.712e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 DMD-225ENST00000481143 621 ntTSL 310.58□□□□□ -0.722e-6■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 IL10RB-203ENST00000451065 898 ntTSL 310.58□□□□□ -0.727e-8■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 ODF2-215ENST00000470061 588 ntTSL 310.56□□□□□ -0.728e-9■■■■■ 155.1
SF3B1O75533 CLN6-203ENST00000563917 557 ntTSL 510.56□□□□□ -0.728e-9■■■■■ 155.1
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