Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA4O75335 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms