Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTIFO43310 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTIFO43310 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTIFO43310 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTIFO43310 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTIFO43310 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTIFO43310 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTIFO43310 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTIFO43310 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTIFO43310 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTIFO43310 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTIFO43310 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTIFO43310 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTIFO43310 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTIFO43310 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTIFO43310 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTIFO43310 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTIFO43310 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTIFO43310 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTIFO43310 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CTIFO43310 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTIFO43310 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTIFO43310 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTIFO43310 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTIFO43310 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CTIFO43310 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CTIFO43310 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTIFO43310 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTIFO43310 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTIFO43310 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTIFO43310 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTIFO43310 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTIFO43310 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTIFO43310 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTIFO43310 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTIFO43310 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTIFO43310 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTIFO43310 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTIFO43310 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTIFO43310 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTIFO43310 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTIFO43310 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTIFO43310 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTIFO43310 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTIFO43310 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTIFO43310 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTIFO43310 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTIFO43310 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTIFO43310 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTIFO43310 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTIFO43310 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTIFO43310 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTIFO43310 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTIFO43310 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTIFO43310 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTIFO43310 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTIFO43310 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTIFO43310 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTIFO43310 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTIFO43310 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTIFO43310 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTIFO43310 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTIFO43310 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTIFO43310 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTIFO43310 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTIFO43310 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTIFO43310 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTIFO43310 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTIFO43310 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTIFO43310 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTIFO43310 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTIFO43310 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTIFO43310 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTIFO43310 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTIFO43310 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTIFO43310 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTIFO43310 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTIFO43310 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTIFO43310 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTIFO43310 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTIFO43310 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CTIFO43310 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTIFO43310 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTIFO43310 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTIFO43310 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTIFO43310 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTIFO43310 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTIFO43310 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTIFO43310 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTIFO43310 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTIFO43310 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTIFO43310 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTIFO43310 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CTIFO43310 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTIFO43310 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTIFO43310 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTIFO43310 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTIFO43310 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTIFO43310 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTIFO43310 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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