Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 PDCD4-AS1-201ENST00000420367 778 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.621e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 WDR37-202ENST00000358220 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.641e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 NAT9-213ENST00000581451 584 ntTSL 311.02□□□□□ -0.651e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 MTMR4-201ENST00000323456 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.711e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 NAT9-209ENST00000580216 611 ntTSL 510.59□□□□□ -0.711e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 WDR59-208ENST00000563111 583 ntTSL 410.54□□□□□ -0.721e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 MTMR4-207ENST00000582663 572 ntTSL 49.26□□□□□ -0.931e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 PDE4D-208ENST00000502484 2478 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.061e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 NAT9-206ENST00000578947 394 ntTSL 37.74□□□□□ -1.171e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.411e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 SORBS1-218ENST00000492542 720 ntTSL 36.1□□□□□ -1.431e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 PDE4D-215ENST00000506510 558 ntTSL 45.19□□□□□ -1.581e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 PDE4D-217ENST00000509355 847 ntTSL 1 (best)5.15□□□□□ -1.591e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 PDE4D-219ENST00000511382 581 ntTSL 44.62□□□□□ -1.671e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 PDE4D-213ENST00000505507 577 ntTSL 43.6□□□□□ -1.831e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 AGRN-205ENST00000469403 899 ntTSL 325.57■■□□□ 1.686e-7■■■■□ 21
PRPF4O43172 AGRN-206ENST00000477585 707 ntTSL 323.13■■□□□ 1.296e-7■■■■□ 21
PRPF4O43172 RPS21-202ENST00000370562 1002 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.512e-25■■■■□ 21
PRPF4O43172 SNTB1-205ENST00000520717 559 ntTSL 227.88■■■□□ 2.051e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 WWC2-207ENST00000508614 604 ntTSL 316.63■□□□□ 0.255e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 TSPAN4-216ENST00000526055 469 ntTSL 217.6■□□□□ 0.411e-6■■■■□ 21
PRPF4O43172 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.282e-8■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 AHCY-204ENST00000480653 2211 ntTSL 216.34■□□□□ 0.212e-8■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.052e-8■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 PHF1-205ENST00000428274 836 ntTSL 512.45□□□□□ -0.421e-7■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 MFSD12-204ENST00000585788 1769 nt19.75■□□□□ 0.752e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 MFSD12-214ENST00000615073 986 ntTSL 319.74■□□□□ 0.752e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 MFSD12-203ENST00000398558 1014 ntTSL 218.32■□□□□ 0.522e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 PCMTD1-205ENST00000521046 856 ntTSL 216.93■□□□□ 0.39e-8■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.269e-8■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.129e-8■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.229e-8■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.279e-8■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 PCMTD1-203ENST00000519559 1204 ntTSL 26.35□□□□□ -1.399e-8■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 TSPAN4-210ENST00000464987 2205 ntTSL 519.52■□□□□ 0.711e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 TSPAN4-213ENST00000524895 401 ntTSL 415.51■□□□□ 0.071e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.011e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 TSPAN4-220ENST00000532375 518 ntTSL 513.18□□□□□ -0.31e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.062e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 AP000662.2-201ENST00000528466 567 ntTSL 415.62■□□□□ 0.092e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 PCYT2-216ENST00000574155 572 ntTSL 415.67■□□□□ 0.13e-9■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 PCYT2-212ENST00000572995 804 ntTSL 314.86□□□□□ -0.033e-9■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 MCM7-208ENST00000467516 776 ntTSL 210.72□□□□□ -0.697e-10■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 SHANK2-221ENST00000618363 434 ntTSL 311.2□□□□□ -0.629e-7■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.149e-7■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.149e-7■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 SELENOO-202ENST00000492092 1626 ntTSL 1 (best)20.74■□□□□ 0.919e-7■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 CCDC85C-201ENST00000380243 16393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.692e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 CCDC85C-203ENST00000554996 619 ntTSL 410.07□□□□□ -0.82e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.692e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.642e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.552e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 CTSA-214ENST00000606788 3056 ntTSL 216.34■□□□□ 0.212e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.082e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 MCM7-206ENST00000465688 481 ntTSL 317.29■□□□□ 0.362e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.741e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.81e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 KCTD15-204ENST00000587658 632 ntTSL 322.81■■□□□ 1.245e-7■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 MYBBP1A-204ENST00000571354 579 ntTSL 322.17■■□□□ 1.143e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 FGFR1-217ENST00000470826 2281 ntTSL 1 (best)22.09■■□□□ 1.133e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 FGFR1-223ENST00000496296 1898 ntTSL 1 (best)21.88■■□□□ 1.093e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 ACSS2-216ENST00000484354 517 ntTSL 521.66■■□□□ 1.063e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.043e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 13e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 SF1-214ENST00000477596 802 ntTSL 221.19■□□□□ 0.983e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.93e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 THAP7-208ENST00000498406 1957 ntTSL 220.23■□□□□ 0.833e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.813e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 SNRPA-211ENST00000601545 695 ntTSL 520.03■□□□□ 0.85e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.763e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 THAP7-206ENST00000476667 1671 ntTSL 519.64■□□□□ 0.733e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 ALDOA-207ENST00000562302 502 ntTSL 1 (best)19.63■□□□□ 0.733e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 CAPN10-213ENST00000465943 549 ntTSL 419.63■□□□□ 0.733e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.735e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.723e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.673e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 RAC3-202ENST00000580965 831 ntTSL 219.02■□□□□ 0.643e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.633e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 THAP7-205ENST00000471723 653 ntTSL 318.84■□□□□ 0.613e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 POLE-205ENST00000503265 1501 ntTSL 418.71■□□□□ 0.593e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.583e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 CD151-206ENST00000525333 561 ntTSL 418.58■□□□□ 0.563e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 THAP7-204ENST00000471073 1809 ntTSL 218.52■□□□□ 0.563e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.563e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 TSC2-209ENST00000463601 600 ntTSL 318.24■□□□□ 0.513e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.484e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 THAP7-203ENST00000466670 1080 ntTSL 517.96■□□□□ 0.473e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 TSPAN14-201ENST00000265450 2588 ntTSL 217.83■□□□□ 0.443e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.443e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.423e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.423e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.353e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.313e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 RRP7A-203ENST00000483303 580 ntTSL 316.8■□□□□ 0.283e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.273e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.253e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.213e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.183e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.183e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 PKM-223ENST00000569050 457 ntTSL 415.97■□□□□ 0.153e-6■■■■□ 20.9
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