Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC12A4Q9UP95 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC12A4Q9UP95 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC12A4Q9UP95 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC12A4Q9UP95 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC12A4Q9UP95 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC12A4Q9UP95 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC12A4Q9UP95 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC12A4Q9UP95 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC12A4Q9UP95 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC12A4Q9UP95 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC12A4Q9UP95 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC12A4Q9UP95 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC12A4Q9UP95 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC12A4Q9UP95 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC12A4Q9UP95 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC12A4Q9UP95 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC12A4Q9UP95 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC12A4Q9UP95 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC12A4Q9UP95 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC12A4Q9UP95 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC12A4Q9UP95 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC12A4Q9UP95 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC12A4Q9UP95 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC12A4Q9UP95 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC12A4Q9UP95 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC12A4Q9UP95 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC12A4Q9UP95 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC12A4Q9UP95 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC12A4Q9UP95 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC12A4Q9UP95 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC12A4Q9UP95 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC12A4Q9UP95 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC12A4Q9UP95 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC12A4Q9UP95 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC12A4Q9UP95 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC12A4Q9UP95 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC12A4Q9UP95 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC12A4Q9UP95 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC12A4Q9UP95 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC12A4Q9UP95 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC12A4Q9UP95 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC12A4Q9UP95 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC12A4Q9UP95 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC12A4Q9UP95 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC12A4Q9UP95 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC12A4Q9UP95 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC12A4Q9UP95 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC12A4Q9UP95 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC12A4Q9UP95 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC12A4Q9UP95 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC12A4Q9UP95 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC12A4Q9UP95 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC12A4Q9UP95 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC12A4Q9UP95 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC12A4Q9UP95 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC12A4Q9UP95 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC12A4Q9UP95 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC12A4Q9UP95 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC12A4Q9UP95 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC12A4Q9UP95 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC12A4Q9UP95 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC12A4Q9UP95 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC12A4Q9UP95 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC12A4Q9UP95 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC12A4Q9UP95 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC12A4Q9UP95 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC12A4Q9UP95 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC12A4Q9UP95 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC12A4Q9UP95 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC12A4Q9UP95 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC12A4Q9UP95 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC12A4Q9UP95 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC12A4Q9UP95 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC12A4Q9UP95 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC12A4Q9UP95 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC12A4Q9UP95 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC12A4Q9UP95 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC12A4Q9UP95 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC12A4Q9UP95 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC12A4Q9UP95 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC12A4Q9UP95 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC12A4Q9UP95 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC12A4Q9UP95 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC12A4Q9UP95 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC12A4Q9UP95 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC12A4Q9UP95 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC12A4Q9UP95 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC12A4Q9UP95 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC12A4Q9UP95 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC12A4Q9UP95 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC12A4Q9UP95 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC12A4Q9UP95 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC12A4Q9UP95 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC12A4Q9UP95 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC12A4Q9UP95 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC12A4Q9UP95 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC12A4Q9UP95 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC12A4Q9UP95 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC12A4Q9UP95 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 225.3 ms