Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
ZNF608Q9ULD9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
ZNF608Q9ULD9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
ZNF608Q9ULD9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC45.19■■■■■ 4.82
ZNF608Q9ULD9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC45.19■■■■■ 4.82
ZNF608Q9ULD9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
ZNF608Q9ULD9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
ZNF608Q9ULD9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
ZNF608Q9ULD9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC45.11■■■■■ 4.81
ZNF608Q9ULD9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
ZNF608Q9ULD9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC45.1■■■■■ 4.81
ZNF608Q9ULD9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC45.09■■■■■ 4.81
ZNF608Q9ULD9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
ZNF608Q9ULD9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.09■■■■■ 4.81
ZNF608Q9ULD9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
ZNF608Q9ULD9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC45.06■■■■■ 4.8
ZNF608Q9ULD9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
ZNF608Q9ULD9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC45.04■■■■■ 4.8
ZNF608Q9ULD9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
ZNF608Q9ULD9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
ZNF608Q9ULD9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
ZNF608Q9ULD9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
ZNF608Q9ULD9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.98■■■■■ 4.79
ZNF608Q9ULD9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
ZNF608Q9ULD9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC44.97■■■■■ 4.79
ZNF608Q9ULD9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC44.97■■■■■ 4.79
ZNF608Q9ULD9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
ZNF608Q9ULD9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
ZNF608Q9ULD9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
ZNF608Q9ULD9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
ZNF608Q9ULD9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.94■■■■■ 4.78
ZNF608Q9ULD9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
ZNF608Q9ULD9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.91■■■■■ 4.78
ZNF608Q9ULD9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC44.88■■■■■ 4.78
ZNF608Q9ULD9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC44.88■■■■■ 4.78
ZNF608Q9ULD9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.77
ZNF608Q9ULD9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC44.87■■■■■ 4.77
ZNF608Q9ULD9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
ZNF608Q9ULD9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
ZNF608Q9ULD9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC44.86■■■■■ 4.77
ZNF608Q9ULD9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC44.86■■■■■ 4.77
ZNF608Q9ULD9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.85■■■■■ 4.77
ZNF608Q9ULD9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC44.84■■■■■ 4.77
ZNF608Q9ULD9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC44.84■■■■■ 4.77
ZNF608Q9ULD9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.83■■■■■ 4.77
ZNF608Q9ULD9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC44.82■■■■■ 4.77
ZNF608Q9ULD9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC44.81■■■■■ 4.76
ZNF608Q9ULD9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
ZNF608Q9ULD9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
ZNF608Q9ULD9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC44.79■■■■■ 4.76
ZNF608Q9ULD9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC44.76■■■■■ 4.76
ZNF608Q9ULD9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC44.75■■■■■ 4.76
ZNF608Q9ULD9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC44.75■■■■■ 4.76
ZNF608Q9ULD9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC44.75■■■■■ 4.75
ZNF608Q9ULD9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
ZNF608Q9ULD9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.71■■■■■ 4.75
ZNF608Q9ULD9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC44.71■■■■■ 4.75
ZNF608Q9ULD9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC44.71■■■■■ 4.75
ZNF608Q9ULD9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC44.71■■■■■ 4.75
ZNF608Q9ULD9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.7■■■■■ 4.75
ZNF608Q9ULD9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.7■■■■■ 4.75
ZNF608Q9ULD9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
ZNF608Q9ULD9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC44.69■■■■■ 4.74
ZNF608Q9ULD9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC44.69■■■■■ 4.74
ZNF608Q9ULD9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC44.68■■■■■ 4.74
ZNF608Q9ULD9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC44.67■■■■■ 4.74
ZNF608Q9ULD9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
ZNF608Q9ULD9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.67■■■■■ 4.74
ZNF608Q9ULD9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
ZNF608Q9ULD9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC44.64■■■■■ 4.74
ZNF608Q9ULD9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.74
ZNF608Q9ULD9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC44.63■■■■■ 4.73
ZNF608Q9ULD9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC44.62■■■■■ 4.73
ZNF608Q9ULD9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC44.61■■■■■ 4.73
ZNF608Q9ULD9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
ZNF608Q9ULD9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
ZNF608Q9ULD9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
ZNF608Q9ULD9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
ZNF608Q9ULD9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
ZNF608Q9ULD9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
ZNF608Q9ULD9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
ZNF608Q9ULD9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
ZNF608Q9ULD9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
ZNF608Q9ULD9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC44.54■■■■■ 4.72
ZNF608Q9ULD9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
ZNF608Q9ULD9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
ZNF608Q9ULD9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.51■■■■■ 4.72
ZNF608Q9ULD9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.5■■■■■ 4.71
ZNF608Q9ULD9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
ZNF608Q9ULD9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
ZNF608Q9ULD9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC44.5■■■■■ 4.71
ZNF608Q9ULD9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC44.5■■■■■ 4.71
ZNF608Q9ULD9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
ZNF608Q9ULD9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
ZNF608Q9ULD9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC44.46■■■■■ 4.71
ZNF608Q9ULD9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC44.45■■■■■ 4.71
ZNF608Q9ULD9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC44.44■■■■■ 4.71
ZNF608Q9ULD9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
ZNF608Q9ULD9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
ZNF608Q9ULD9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC44.41■■■■■ 4.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms