Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
RCAN3Q9UKA8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
RCAN3Q9UKA8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RCAN3Q9UKA8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RCAN3Q9UKA8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RCAN3Q9UKA8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
RCAN3Q9UKA8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
RCAN3Q9UKA8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RCAN3Q9UKA8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RCAN3Q9UKA8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RCAN3Q9UKA8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RCAN3Q9UKA8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RCAN3Q9UKA8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RCAN3Q9UKA8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RCAN3Q9UKA8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RCAN3Q9UKA8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RCAN3Q9UKA8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RCAN3Q9UKA8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RCAN3Q9UKA8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RCAN3Q9UKA8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RCAN3Q9UKA8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RCAN3Q9UKA8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RCAN3Q9UKA8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RCAN3Q9UKA8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RCAN3Q9UKA8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RCAN3Q9UKA8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RCAN3Q9UKA8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RCAN3Q9UKA8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RCAN3Q9UKA8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RCAN3Q9UKA8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RCAN3Q9UKA8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
RCAN3Q9UKA8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RCAN3Q9UKA8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RCAN3Q9UKA8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
RCAN3Q9UKA8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
RCAN3Q9UKA8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RCAN3Q9UKA8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RCAN3Q9UKA8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RCAN3Q9UKA8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RCAN3Q9UKA8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RCAN3Q9UKA8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RCAN3Q9UKA8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RCAN3Q9UKA8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
RCAN3Q9UKA8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
RCAN3Q9UKA8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RCAN3Q9UKA8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RCAN3Q9UKA8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
RCAN3Q9UKA8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RCAN3Q9UKA8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RCAN3Q9UKA8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RCAN3Q9UKA8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RCAN3Q9UKA8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RCAN3Q9UKA8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RCAN3Q9UKA8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RCAN3Q9UKA8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RCAN3Q9UKA8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RCAN3Q9UKA8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RCAN3Q9UKA8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RCAN3Q9UKA8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RCAN3Q9UKA8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
RCAN3Q9UKA8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RCAN3Q9UKA8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RCAN3Q9UKA8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RCAN3Q9UKA8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RCAN3Q9UKA8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RCAN3Q9UKA8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RCAN3Q9UKA8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
RCAN3Q9UKA8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RCAN3Q9UKA8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RCAN3Q9UKA8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RCAN3Q9UKA8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RCAN3Q9UKA8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RCAN3Q9UKA8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RCAN3Q9UKA8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RCAN3Q9UKA8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RCAN3Q9UKA8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RCAN3Q9UKA8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
RCAN3Q9UKA8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC33.82■■■■□ 3
RCAN3Q9UKA8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
RCAN3Q9UKA8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
RCAN3Q9UKA8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
RCAN3Q9UKA8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RCAN3Q9UKA8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
RCAN3Q9UKA8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RCAN3Q9UKA8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RCAN3Q9UKA8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RCAN3Q9UKA8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RCAN3Q9UKA8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
RCAN3Q9UKA8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
RCAN3Q9UKA8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
RCAN3Q9UKA8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
RCAN3Q9UKA8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RCAN3Q9UKA8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RCAN3Q9UKA8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RCAN3Q9UKA8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RCAN3Q9UKA8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RCAN3Q9UKA8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RCAN3Q9UKA8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RCAN3Q9UKA8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RCAN3Q9UKA8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms