Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBI1

COMMD3, COMM domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 195 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD3Q9UBI1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COMMD3Q9UBI1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COMMD3Q9UBI1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COMMD3Q9UBI1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COMMD3Q9UBI1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COMMD3Q9UBI1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COMMD3Q9UBI1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COMMD3Q9UBI1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COMMD3Q9UBI1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COMMD3Q9UBI1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COMMD3Q9UBI1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COMMD3Q9UBI1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COMMD3Q9UBI1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
COMMD3Q9UBI1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COMMD3Q9UBI1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COMMD3Q9UBI1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COMMD3Q9UBI1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COMMD3Q9UBI1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COMMD3Q9UBI1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COMMD3Q9UBI1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COMMD3Q9UBI1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COMMD3Q9UBI1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COMMD3Q9UBI1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COMMD3Q9UBI1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COMMD3Q9UBI1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COMMD3Q9UBI1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COMMD3Q9UBI1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COMMD3Q9UBI1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COMMD3Q9UBI1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COMMD3Q9UBI1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COMMD3Q9UBI1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COMMD3Q9UBI1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COMMD3Q9UBI1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COMMD3Q9UBI1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COMMD3Q9UBI1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COMMD3Q9UBI1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COMMD3Q9UBI1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COMMD3Q9UBI1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COMMD3Q9UBI1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COMMD3Q9UBI1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COMMD3Q9UBI1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COMMD3Q9UBI1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COMMD3Q9UBI1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COMMD3Q9UBI1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COMMD3Q9UBI1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COMMD3Q9UBI1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COMMD3Q9UBI1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COMMD3Q9UBI1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COMMD3Q9UBI1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COMMD3Q9UBI1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COMMD3Q9UBI1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COMMD3Q9UBI1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COMMD3Q9UBI1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COMMD3Q9UBI1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COMMD3Q9UBI1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COMMD3Q9UBI1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COMMD3Q9UBI1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COMMD3Q9UBI1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COMMD3Q9UBI1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COMMD3Q9UBI1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COMMD3Q9UBI1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COMMD3Q9UBI1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COMMD3Q9UBI1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COMMD3Q9UBI1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COMMD3Q9UBI1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COMMD3Q9UBI1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COMMD3Q9UBI1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COMMD3Q9UBI1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COMMD3Q9UBI1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COMMD3Q9UBI1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COMMD3Q9UBI1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COMMD3Q9UBI1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COMMD3Q9UBI1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COMMD3Q9UBI1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COMMD3Q9UBI1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COMMD3Q9UBI1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COMMD3Q9UBI1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COMMD3Q9UBI1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COMMD3Q9UBI1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COMMD3Q9UBI1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COMMD3Q9UBI1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COMMD3Q9UBI1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COMMD3Q9UBI1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COMMD3Q9UBI1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COMMD3Q9UBI1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COMMD3Q9UBI1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COMMD3Q9UBI1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COMMD3Q9UBI1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COMMD3Q9UBI1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COMMD3Q9UBI1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COMMD3Q9UBI1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COMMD3Q9UBI1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COMMD3Q9UBI1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COMMD3Q9UBI1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COMMD3Q9UBI1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COMMD3Q9UBI1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COMMD3Q9UBI1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COMMD3Q9UBI1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COMMD3Q9UBI1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COMMD3Q9UBI1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
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