Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CALCOCO1Q9P1Z2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CALCOCO1Q9P1Z2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CALCOCO1Q9P1Z2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CALCOCO1Q9P1Z2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CALCOCO1Q9P1Z2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CALCOCO1Q9P1Z2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CALCOCO1Q9P1Z2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CALCOCO1Q9P1Z2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CALCOCO1Q9P1Z2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CALCOCO1Q9P1Z2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CALCOCO1Q9P1Z2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CALCOCO1Q9P1Z2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CALCOCO1Q9P1Z2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CALCOCO1Q9P1Z2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CALCOCO1Q9P1Z2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CALCOCO1Q9P1Z2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CALCOCO1Q9P1Z2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CALCOCO1Q9P1Z2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CALCOCO1Q9P1Z2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CALCOCO1Q9P1Z2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CALCOCO1Q9P1Z2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CALCOCO1Q9P1Z2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CALCOCO1Q9P1Z2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CALCOCO1Q9P1Z2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CALCOCO1Q9P1Z2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CALCOCO1Q9P1Z2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CALCOCO1Q9P1Z2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CALCOCO1Q9P1Z2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CALCOCO1Q9P1Z2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CALCOCO1Q9P1Z2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CALCOCO1Q9P1Z2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CALCOCO1Q9P1Z2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CALCOCO1Q9P1Z2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CALCOCO1Q9P1Z2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CALCOCO1Q9P1Z2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CALCOCO1Q9P1Z2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CALCOCO1Q9P1Z2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CALCOCO1Q9P1Z2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CALCOCO1Q9P1Z2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CALCOCO1Q9P1Z2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CALCOCO1Q9P1Z2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CALCOCO1Q9P1Z2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CALCOCO1Q9P1Z2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CALCOCO1Q9P1Z2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CALCOCO1Q9P1Z2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CALCOCO1Q9P1Z2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CALCOCO1Q9P1Z2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CALCOCO1Q9P1Z2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CALCOCO1Q9P1Z2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CALCOCO1Q9P1Z2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CALCOCO1Q9P1Z2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CALCOCO1Q9P1Z2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CALCOCO1Q9P1Z2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CALCOCO1Q9P1Z2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CALCOCO1Q9P1Z2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CALCOCO1Q9P1Z2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CALCOCO1Q9P1Z2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CALCOCO1Q9P1Z2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CALCOCO1Q9P1Z2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CALCOCO1Q9P1Z2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CALCOCO1Q9P1Z2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CALCOCO1Q9P1Z2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CALCOCO1Q9P1Z2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CALCOCO1Q9P1Z2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CALCOCO1Q9P1Z2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CALCOCO1Q9P1Z2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CALCOCO1Q9P1Z2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CALCOCO1Q9P1Z2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CALCOCO1Q9P1Z2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CALCOCO1Q9P1Z2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CALCOCO1Q9P1Z2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CALCOCO1Q9P1Z2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CALCOCO1Q9P1Z2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CALCOCO1Q9P1Z2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CALCOCO1Q9P1Z2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CALCOCO1Q9P1Z2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CALCOCO1Q9P1Z2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CALCOCO1Q9P1Z2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CALCOCO1Q9P1Z2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CALCOCO1Q9P1Z2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CALCOCO1Q9P1Z2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CALCOCO1Q9P1Z2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CALCOCO1Q9P1Z2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CALCOCO1Q9P1Z2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CALCOCO1Q9P1Z2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CALCOCO1Q9P1Z2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CALCOCO1Q9P1Z2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms