Protein–RNA interactions for Protein: Q9P109

GCNT4, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT4Q9P109 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GCNT4Q9P109 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GCNT4Q9P109 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GCNT4Q9P109 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GCNT4Q9P109 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GCNT4Q9P109 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GCNT4Q9P109 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GCNT4Q9P109 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GCNT4Q9P109 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GCNT4Q9P109 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GCNT4Q9P109 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GCNT4Q9P109 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GCNT4Q9P109 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GCNT4Q9P109 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GCNT4Q9P109 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GCNT4Q9P109 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GCNT4Q9P109 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GCNT4Q9P109 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GCNT4Q9P109 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GCNT4Q9P109 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GCNT4Q9P109 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GCNT4Q9P109 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GCNT4Q9P109 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GCNT4Q9P109 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GCNT4Q9P109 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GCNT4Q9P109 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GCNT4Q9P109 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GCNT4Q9P109 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GCNT4Q9P109 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
GCNT4Q9P109 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GCNT4Q9P109 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GCNT4Q9P109 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GCNT4Q9P109 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GCNT4Q9P109 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GCNT4Q9P109 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GCNT4Q9P109 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GCNT4Q9P109 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GCNT4Q9P109 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GCNT4Q9P109 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
GCNT4Q9P109 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GCNT4Q9P109 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GCNT4Q9P109 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GCNT4Q9P109 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
GCNT4Q9P109 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GCNT4Q9P109 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GCNT4Q9P109 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GCNT4Q9P109 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GCNT4Q9P109 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GCNT4Q9P109 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GCNT4Q9P109 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GCNT4Q9P109 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
GCNT4Q9P109 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GCNT4Q9P109 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GCNT4Q9P109 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GCNT4Q9P109 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GCNT4Q9P109 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GCNT4Q9P109 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GCNT4Q9P109 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GCNT4Q9P109 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GCNT4Q9P109 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GCNT4Q9P109 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GCNT4Q9P109 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GCNT4Q9P109 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GCNT4Q9P109 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GCNT4Q9P109 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GCNT4Q9P109 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GCNT4Q9P109 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GCNT4Q9P109 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GCNT4Q9P109 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
GCNT4Q9P109 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GCNT4Q9P109 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
GCNT4Q9P109 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GCNT4Q9P109 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GCNT4Q9P109 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GCNT4Q9P109 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GCNT4Q9P109 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GCNT4Q9P109 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GCNT4Q9P109 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GCNT4Q9P109 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GCNT4Q9P109 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GCNT4Q9P109 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
GCNT4Q9P109 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GCNT4Q9P109 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GCNT4Q9P109 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GCNT4Q9P109 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GCNT4Q9P109 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GCNT4Q9P109 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GCNT4Q9P109 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GCNT4Q9P109 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GCNT4Q9P109 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GCNT4Q9P109 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GCNT4Q9P109 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GCNT4Q9P109 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GCNT4Q9P109 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GCNT4Q9P109 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GCNT4Q9P109 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GCNT4Q9P109 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GCNT4Q9P109 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GCNT4Q9P109 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
GCNT4Q9P109 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms