Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MSRB1Q9NZV6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MSRB1Q9NZV6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MSRB1Q9NZV6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MSRB1Q9NZV6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MSRB1Q9NZV6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MSRB1Q9NZV6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MSRB1Q9NZV6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MSRB1Q9NZV6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MSRB1Q9NZV6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MSRB1Q9NZV6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MSRB1Q9NZV6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MSRB1Q9NZV6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
MSRB1Q9NZV6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MSRB1Q9NZV6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MSRB1Q9NZV6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MSRB1Q9NZV6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MSRB1Q9NZV6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MSRB1Q9NZV6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MSRB1Q9NZV6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MSRB1Q9NZV6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MSRB1Q9NZV6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MSRB1Q9NZV6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MSRB1Q9NZV6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MSRB1Q9NZV6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MSRB1Q9NZV6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MSRB1Q9NZV6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MSRB1Q9NZV6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MSRB1Q9NZV6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MSRB1Q9NZV6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MSRB1Q9NZV6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MSRB1Q9NZV6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MSRB1Q9NZV6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MSRB1Q9NZV6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MSRB1Q9NZV6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MSRB1Q9NZV6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MSRB1Q9NZV6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MSRB1Q9NZV6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MSRB1Q9NZV6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MSRB1Q9NZV6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MSRB1Q9NZV6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MSRB1Q9NZV6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MSRB1Q9NZV6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MSRB1Q9NZV6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MSRB1Q9NZV6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MSRB1Q9NZV6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MSRB1Q9NZV6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MSRB1Q9NZV6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MSRB1Q9NZV6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MSRB1Q9NZV6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MSRB1Q9NZV6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MSRB1Q9NZV6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MSRB1Q9NZV6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
MSRB1Q9NZV6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MSRB1Q9NZV6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MSRB1Q9NZV6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MSRB1Q9NZV6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MSRB1Q9NZV6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MSRB1Q9NZV6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MSRB1Q9NZV6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MSRB1Q9NZV6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MSRB1Q9NZV6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MSRB1Q9NZV6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MSRB1Q9NZV6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MSRB1Q9NZV6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MSRB1Q9NZV6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MSRB1Q9NZV6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MSRB1Q9NZV6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MSRB1Q9NZV6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MSRB1Q9NZV6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MSRB1Q9NZV6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MSRB1Q9NZV6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MSRB1Q9NZV6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MSRB1Q9NZV6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MSRB1Q9NZV6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MSRB1Q9NZV6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MSRB1Q9NZV6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MSRB1Q9NZV6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MSRB1Q9NZV6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MSRB1Q9NZV6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MSRB1Q9NZV6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MSRB1Q9NZV6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MSRB1Q9NZV6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MSRB1Q9NZV6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MSRB1Q9NZV6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MSRB1Q9NZV6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MSRB1Q9NZV6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MSRB1Q9NZV6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MSRB1Q9NZV6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MSRB1Q9NZV6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MSRB1Q9NZV6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MSRB1Q9NZV6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MSRB1Q9NZV6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MSRB1Q9NZV6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MSRB1Q9NZV6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MSRB1Q9NZV6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MSRB1Q9NZV6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MSRB1Q9NZV6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MSRB1Q9NZV6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MSRB1Q9NZV6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms