Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSRB1Q9NZV6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MSRB1Q9NZV6 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSRB1Q9NZV6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MSRB1Q9NZV6 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSRB1Q9NZV6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MSRB1Q9NZV6 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSRB1Q9NZV6 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MSRB1Q9NZV6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MSRB1Q9NZV6 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MSRB1Q9NZV6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MSRB1Q9NZV6 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSRB1Q9NZV6 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSRB1Q9NZV6 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSRB1Q9NZV6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MSRB1Q9NZV6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSRB1Q9NZV6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MSRB1Q9NZV6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MSRB1Q9NZV6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MSRB1Q9NZV6 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSRB1Q9NZV6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSRB1Q9NZV6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSRB1Q9NZV6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSRB1Q9NZV6 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSRB1Q9NZV6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSRB1Q9NZV6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSRB1Q9NZV6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSRB1Q9NZV6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSRB1Q9NZV6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSRB1Q9NZV6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSRB1Q9NZV6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MSRB1Q9NZV6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSRB1Q9NZV6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSRB1Q9NZV6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSRB1Q9NZV6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSRB1Q9NZV6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSRB1Q9NZV6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSRB1Q9NZV6 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSRB1Q9NZV6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSRB1Q9NZV6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSRB1Q9NZV6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSRB1Q9NZV6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSRB1Q9NZV6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSRB1Q9NZV6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSRB1Q9NZV6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSRB1Q9NZV6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSRB1Q9NZV6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSRB1Q9NZV6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MSRB1Q9NZV6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSRB1Q9NZV6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MSRB1Q9NZV6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MSRB1Q9NZV6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MSRB1Q9NZV6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MSRB1Q9NZV6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MSRB1Q9NZV6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MSRB1Q9NZV6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MSRB1Q9NZV6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MSRB1Q9NZV6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MSRB1Q9NZV6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MSRB1Q9NZV6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MSRB1Q9NZV6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MSRB1Q9NZV6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MSRB1Q9NZV6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MSRB1Q9NZV6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MSRB1Q9NZV6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSRB1Q9NZV6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSRB1Q9NZV6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MSRB1Q9NZV6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSRB1Q9NZV6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSRB1Q9NZV6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSRB1Q9NZV6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSRB1Q9NZV6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSRB1Q9NZV6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MSRB1Q9NZV6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MSRB1Q9NZV6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MSRB1Q9NZV6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MSRB1Q9NZV6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MSRB1Q9NZV6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSRB1Q9NZV6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSRB1Q9NZV6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MSRB1Q9NZV6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSRB1Q9NZV6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSRB1Q9NZV6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSRB1Q9NZV6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSRB1Q9NZV6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSRB1Q9NZV6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSRB1Q9NZV6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSRB1Q9NZV6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSRB1Q9NZV6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSRB1Q9NZV6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSRB1Q9NZV6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MSRB1Q9NZV6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSRB1Q9NZV6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MSRB1Q9NZV6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MSRB1Q9NZV6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MSRB1Q9NZV6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MSRB1Q9NZV6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MSRB1Q9NZV6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MSRB1Q9NZV6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MSRB1Q9NZV6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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