Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYK5

MRPL39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL39Q9NYK5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRPL39Q9NYK5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRPL39Q9NYK5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRPL39Q9NYK5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRPL39Q9NYK5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRPL39Q9NYK5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRPL39Q9NYK5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRPL39Q9NYK5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRPL39Q9NYK5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRPL39Q9NYK5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPL39Q9NYK5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRPL39Q9NYK5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRPL39Q9NYK5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRPL39Q9NYK5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRPL39Q9NYK5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRPL39Q9NYK5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRPL39Q9NYK5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRPL39Q9NYK5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRPL39Q9NYK5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRPL39Q9NYK5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRPL39Q9NYK5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRPL39Q9NYK5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRPL39Q9NYK5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRPL39Q9NYK5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRPL39Q9NYK5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRPL39Q9NYK5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRPL39Q9NYK5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRPL39Q9NYK5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRPL39Q9NYK5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRPL39Q9NYK5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRPL39Q9NYK5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRPL39Q9NYK5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRPL39Q9NYK5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MRPL39Q9NYK5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRPL39Q9NYK5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRPL39Q9NYK5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRPL39Q9NYK5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRPL39Q9NYK5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPL39Q9NYK5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPL39Q9NYK5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPL39Q9NYK5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPL39Q9NYK5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPL39Q9NYK5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPL39Q9NYK5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPL39Q9NYK5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPL39Q9NYK5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPL39Q9NYK5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPL39Q9NYK5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPL39Q9NYK5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRPL39Q9NYK5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPL39Q9NYK5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPL39Q9NYK5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPL39Q9NYK5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPL39Q9NYK5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPL39Q9NYK5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRPL39Q9NYK5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRPL39Q9NYK5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRPL39Q9NYK5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRPL39Q9NYK5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRPL39Q9NYK5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MRPL39Q9NYK5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRPL39Q9NYK5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRPL39Q9NYK5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRPL39Q9NYK5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRPL39Q9NYK5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRPL39Q9NYK5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRPL39Q9NYK5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRPL39Q9NYK5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRPL39Q9NYK5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRPL39Q9NYK5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRPL39Q9NYK5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRPL39Q9NYK5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MRPL39Q9NYK5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MRPL39Q9NYK5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MRPL39Q9NYK5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRPL39Q9NYK5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRPL39Q9NYK5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRPL39Q9NYK5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRPL39Q9NYK5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRPL39Q9NYK5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRPL39Q9NYK5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRPL39Q9NYK5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRPL39Q9NYK5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRPL39Q9NYK5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRPL39Q9NYK5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRPL39Q9NYK5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRPL39Q9NYK5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRPL39Q9NYK5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MRPL39Q9NYK5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRPL39Q9NYK5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRPL39Q9NYK5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRPL39Q9NYK5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRPL39Q9NYK5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRPL39Q9NYK5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRPL39Q9NYK5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRPL39Q9NYK5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPL39Q9NYK5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPL39Q9NYK5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL39Q9NYK5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL39Q9NYK5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms