Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTN9

SEMA4G, Semaphorin-4G, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4GQ9NTN9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SEMA4GQ9NTN9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEMA4GQ9NTN9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEMA4GQ9NTN9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEMA4GQ9NTN9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEMA4GQ9NTN9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEMA4GQ9NTN9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEMA4GQ9NTN9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEMA4GQ9NTN9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEMA4GQ9NTN9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEMA4GQ9NTN9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEMA4GQ9NTN9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEMA4GQ9NTN9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEMA4GQ9NTN9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEMA4GQ9NTN9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEMA4GQ9NTN9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEMA4GQ9NTN9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMA4GQ9NTN9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMA4GQ9NTN9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMA4GQ9NTN9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMA4GQ9NTN9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEMA4GQ9NTN9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEMA4GQ9NTN9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SEMA4GQ9NTN9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SEMA4GQ9NTN9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SEMA4GQ9NTN9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEMA4GQ9NTN9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SEMA4GQ9NTN9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEMA4GQ9NTN9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEMA4GQ9NTN9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEMA4GQ9NTN9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SEMA4GQ9NTN9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEMA4GQ9NTN9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEMA4GQ9NTN9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEMA4GQ9NTN9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEMA4GQ9NTN9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEMA4GQ9NTN9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEMA4GQ9NTN9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEMA4GQ9NTN9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEMA4GQ9NTN9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEMA4GQ9NTN9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEMA4GQ9NTN9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEMA4GQ9NTN9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEMA4GQ9NTN9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEMA4GQ9NTN9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEMA4GQ9NTN9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEMA4GQ9NTN9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEMA4GQ9NTN9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEMA4GQ9NTN9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEMA4GQ9NTN9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEMA4GQ9NTN9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEMA4GQ9NTN9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEMA4GQ9NTN9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEMA4GQ9NTN9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEMA4GQ9NTN9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEMA4GQ9NTN9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEMA4GQ9NTN9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEMA4GQ9NTN9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEMA4GQ9NTN9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SEMA4GQ9NTN9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEMA4GQ9NTN9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEMA4GQ9NTN9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEMA4GQ9NTN9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEMA4GQ9NTN9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SEMA4GQ9NTN9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEMA4GQ9NTN9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEMA4GQ9NTN9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SEMA4GQ9NTN9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEMA4GQ9NTN9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEMA4GQ9NTN9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEMA4GQ9NTN9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEMA4GQ9NTN9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEMA4GQ9NTN9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMA4GQ9NTN9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMA4GQ9NTN9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMA4GQ9NTN9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMA4GQ9NTN9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEMA4GQ9NTN9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEMA4GQ9NTN9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEMA4GQ9NTN9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEMA4GQ9NTN9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEMA4GQ9NTN9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEMA4GQ9NTN9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SEMA4GQ9NTN9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEMA4GQ9NTN9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMA4GQ9NTN9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMA4GQ9NTN9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEMA4GQ9NTN9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEMA4GQ9NTN9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEMA4GQ9NTN9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEMA4GQ9NTN9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEMA4GQ9NTN9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEMA4GQ9NTN9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEMA4GQ9NTN9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMA4GQ9NTN9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMA4GQ9NTN9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMA4GQ9NTN9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMA4GQ9NTN9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMA4GQ9NTN9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMA4GQ9NTN9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms