Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SERINC1Q9NRX5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SERINC1Q9NRX5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SERINC1Q9NRX5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SERINC1Q9NRX5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SERINC1Q9NRX5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SERINC1Q9NRX5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SERINC1Q9NRX5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SERINC1Q9NRX5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SERINC1Q9NRX5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SERINC1Q9NRX5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SERINC1Q9NRX5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SERINC1Q9NRX5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SERINC1Q9NRX5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SERINC1Q9NRX5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SERINC1Q9NRX5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SERINC1Q9NRX5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SERINC1Q9NRX5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SERINC1Q9NRX5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SERINC1Q9NRX5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SERINC1Q9NRX5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SERINC1Q9NRX5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SERINC1Q9NRX5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SERINC1Q9NRX5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SERINC1Q9NRX5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERINC1Q9NRX5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERINC1Q9NRX5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERINC1Q9NRX5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERINC1Q9NRX5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SERINC1Q9NRX5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SERINC1Q9NRX5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SERINC1Q9NRX5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SERINC1Q9NRX5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SERINC1Q9NRX5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SERINC1Q9NRX5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SERINC1Q9NRX5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SERINC1Q9NRX5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SERINC1Q9NRX5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SERINC1Q9NRX5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SERINC1Q9NRX5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SERINC1Q9NRX5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SERINC1Q9NRX5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SERINC1Q9NRX5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SERINC1Q9NRX5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SERINC1Q9NRX5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SERINC1Q9NRX5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SERINC1Q9NRX5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SERINC1Q9NRX5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SERINC1Q9NRX5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SERINC1Q9NRX5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SERINC1Q9NRX5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SERINC1Q9NRX5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SERINC1Q9NRX5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SERINC1Q9NRX5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SERINC1Q9NRX5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SERINC1Q9NRX5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SERINC1Q9NRX5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SERINC1Q9NRX5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SERINC1Q9NRX5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SERINC1Q9NRX5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SERINC1Q9NRX5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SERINC1Q9NRX5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SERINC1Q9NRX5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERINC1Q9NRX5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERINC1Q9NRX5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERINC1Q9NRX5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERINC1Q9NRX5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERINC1Q9NRX5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERINC1Q9NRX5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERINC1Q9NRX5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SERINC1Q9NRX5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SERINC1Q9NRX5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SERINC1Q9NRX5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SERINC1Q9NRX5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SERINC1Q9NRX5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SERINC1Q9NRX5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SERINC1Q9NRX5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SERINC1Q9NRX5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERINC1Q9NRX5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERINC1Q9NRX5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERINC1Q9NRX5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERINC1Q9NRX5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERINC1Q9NRX5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERINC1Q9NRX5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERINC1Q9NRX5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERINC1Q9NRX5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SERINC1Q9NRX5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERINC1Q9NRX5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERINC1Q9NRX5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERINC1Q9NRX5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERINC1Q9NRX5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERINC1Q9NRX5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERINC1Q9NRX5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERINC1Q9NRX5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERINC1Q9NRX5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERINC1Q9NRX5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERINC1Q9NRX5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERINC1Q9NRX5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERINC1Q9NRX5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SERINC1Q9NRX5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms