Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR7

CCDC177, Coiled-coil domain-containing protein 177, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC177Q9NQR7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC177Q9NQR7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC177Q9NQR7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC177Q9NQR7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC177Q9NQR7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC177Q9NQR7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC177Q9NQR7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC177Q9NQR7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC177Q9NQR7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC177Q9NQR7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC177Q9NQR7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC177Q9NQR7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC177Q9NQR7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC177Q9NQR7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC177Q9NQR7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC177Q9NQR7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC177Q9NQR7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC177Q9NQR7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC177Q9NQR7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC177Q9NQR7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC177Q9NQR7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC177Q9NQR7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC177Q9NQR7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC177Q9NQR7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC177Q9NQR7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC177Q9NQR7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC177Q9NQR7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC177Q9NQR7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC177Q9NQR7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC177Q9NQR7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC177Q9NQR7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC177Q9NQR7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC177Q9NQR7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC177Q9NQR7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC177Q9NQR7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC177Q9NQR7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC177Q9NQR7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC177Q9NQR7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC177Q9NQR7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC177Q9NQR7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC177Q9NQR7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC177Q9NQR7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC177Q9NQR7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC177Q9NQR7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC177Q9NQR7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC177Q9NQR7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC177Q9NQR7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC177Q9NQR7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC177Q9NQR7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC177Q9NQR7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC177Q9NQR7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC177Q9NQR7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC177Q9NQR7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC177Q9NQR7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC177Q9NQR7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC177Q9NQR7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC177Q9NQR7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC177Q9NQR7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC177Q9NQR7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC177Q9NQR7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC177Q9NQR7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC177Q9NQR7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC177Q9NQR7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC177Q9NQR7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC177Q9NQR7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC177Q9NQR7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC177Q9NQR7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC177Q9NQR7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC177Q9NQR7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC177Q9NQR7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC177Q9NQR7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC177Q9NQR7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC177Q9NQR7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC177Q9NQR7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC177Q9NQR7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC177Q9NQR7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC177Q9NQR7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC177Q9NQR7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC177Q9NQR7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC177Q9NQR7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC177Q9NQR7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC177Q9NQR7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC177Q9NQR7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC177Q9NQR7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC177Q9NQR7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC177Q9NQR7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC177Q9NQR7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC177Q9NQR7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC177Q9NQR7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC177Q9NQR7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC177Q9NQR7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC177Q9NQR7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC177Q9NQR7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC177Q9NQR7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC177Q9NQR7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC177Q9NQR7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC177Q9NQR7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC177Q9NQR7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC177Q9NQR7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC177Q9NQR7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms