Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8Y1

VRTN, Vertnin, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VRTNQ9H8Y1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VRTNQ9H8Y1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VRTNQ9H8Y1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VRTNQ9H8Y1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
VRTNQ9H8Y1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VRTNQ9H8Y1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VRTNQ9H8Y1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VRTNQ9H8Y1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VRTNQ9H8Y1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VRTNQ9H8Y1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
VRTNQ9H8Y1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VRTNQ9H8Y1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VRTNQ9H8Y1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VRTNQ9H8Y1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VRTNQ9H8Y1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VRTNQ9H8Y1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VRTNQ9H8Y1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
VRTNQ9H8Y1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VRTNQ9H8Y1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VRTNQ9H8Y1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VRTNQ9H8Y1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VRTNQ9H8Y1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
VRTNQ9H8Y1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VRTNQ9H8Y1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VRTNQ9H8Y1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VRTNQ9H8Y1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VRTNQ9H8Y1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VRTNQ9H8Y1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VRTNQ9H8Y1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VRTNQ9H8Y1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
VRTNQ9H8Y1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VRTNQ9H8Y1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VRTNQ9H8Y1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VRTNQ9H8Y1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VRTNQ9H8Y1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VRTNQ9H8Y1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VRTNQ9H8Y1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VRTNQ9H8Y1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VRTNQ9H8Y1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VRTNQ9H8Y1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VRTNQ9H8Y1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VRTNQ9H8Y1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VRTNQ9H8Y1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VRTNQ9H8Y1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VRTNQ9H8Y1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VRTNQ9H8Y1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VRTNQ9H8Y1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VRTNQ9H8Y1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VRTNQ9H8Y1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VRTNQ9H8Y1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VRTNQ9H8Y1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VRTNQ9H8Y1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
VRTNQ9H8Y1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
VRTNQ9H8Y1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VRTNQ9H8Y1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VRTNQ9H8Y1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
VRTNQ9H8Y1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VRTNQ9H8Y1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VRTNQ9H8Y1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VRTNQ9H8Y1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VRTNQ9H8Y1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VRTNQ9H8Y1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VRTNQ9H8Y1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VRTNQ9H8Y1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VRTNQ9H8Y1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
VRTNQ9H8Y1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
VRTNQ9H8Y1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VRTNQ9H8Y1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VRTNQ9H8Y1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VRTNQ9H8Y1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VRTNQ9H8Y1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VRTNQ9H8Y1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VRTNQ9H8Y1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VRTNQ9H8Y1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VRTNQ9H8Y1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
VRTNQ9H8Y1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VRTNQ9H8Y1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
VRTNQ9H8Y1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VRTNQ9H8Y1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VRTNQ9H8Y1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VRTNQ9H8Y1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
VRTNQ9H8Y1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
VRTNQ9H8Y1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VRTNQ9H8Y1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VRTNQ9H8Y1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VRTNQ9H8Y1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VRTNQ9H8Y1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VRTNQ9H8Y1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VRTNQ9H8Y1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VRTNQ9H8Y1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VRTNQ9H8Y1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VRTNQ9H8Y1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VRTNQ9H8Y1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VRTNQ9H8Y1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VRTNQ9H8Y1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VRTNQ9H8Y1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VRTNQ9H8Y1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VRTNQ9H8Y1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VRTNQ9H8Y1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VRTNQ9H8Y1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms