Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4B7

TUBB1, Tubulin beta-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB1Q9H4B7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBB1Q9H4B7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBB1Q9H4B7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBB1Q9H4B7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBB1Q9H4B7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBB1Q9H4B7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBB1Q9H4B7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBB1Q9H4B7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBB1Q9H4B7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBB1Q9H4B7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBB1Q9H4B7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBB1Q9H4B7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBB1Q9H4B7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBB1Q9H4B7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBB1Q9H4B7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBB1Q9H4B7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBB1Q9H4B7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBB1Q9H4B7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBB1Q9H4B7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBB1Q9H4B7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBB1Q9H4B7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBB1Q9H4B7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBB1Q9H4B7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBB1Q9H4B7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBB1Q9H4B7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBB1Q9H4B7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBB1Q9H4B7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBB1Q9H4B7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBB1Q9H4B7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBB1Q9H4B7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBB1Q9H4B7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBB1Q9H4B7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBB1Q9H4B7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBB1Q9H4B7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBB1Q9H4B7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBB1Q9H4B7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBB1Q9H4B7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBB1Q9H4B7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBB1Q9H4B7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBB1Q9H4B7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBB1Q9H4B7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBB1Q9H4B7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBB1Q9H4B7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBB1Q9H4B7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBB1Q9H4B7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBB1Q9H4B7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBB1Q9H4B7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBB1Q9H4B7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBB1Q9H4B7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBB1Q9H4B7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBB1Q9H4B7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBB1Q9H4B7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBB1Q9H4B7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBB1Q9H4B7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBB1Q9H4B7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBB1Q9H4B7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBB1Q9H4B7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBB1Q9H4B7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBB1Q9H4B7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBB1Q9H4B7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBB1Q9H4B7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBB1Q9H4B7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBB1Q9H4B7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBB1Q9H4B7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBB1Q9H4B7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBB1Q9H4B7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBB1Q9H4B7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBB1Q9H4B7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBB1Q9H4B7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBB1Q9H4B7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBB1Q9H4B7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBB1Q9H4B7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBB1Q9H4B7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBB1Q9H4B7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBB1Q9H4B7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBB1Q9H4B7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBB1Q9H4B7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBB1Q9H4B7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBB1Q9H4B7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBB1Q9H4B7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBB1Q9H4B7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBB1Q9H4B7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TUBB1Q9H4B7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBB1Q9H4B7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBB1Q9H4B7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBB1Q9H4B7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBB1Q9H4B7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBB1Q9H4B7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBB1Q9H4B7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBB1Q9H4B7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBB1Q9H4B7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBB1Q9H4B7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBB1Q9H4B7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBB1Q9H4B7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBB1Q9H4B7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBB1Q9H4B7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBB1Q9H4B7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBB1Q9H4B7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBB1Q9H4B7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBB1Q9H4B7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms