Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3P2

NELFA, Negative elongation factor A, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFAQ9H3P2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NELFAQ9H3P2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NELFAQ9H3P2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NELFAQ9H3P2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NELFAQ9H3P2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NELFAQ9H3P2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NELFAQ9H3P2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NELFAQ9H3P2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NELFAQ9H3P2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NELFAQ9H3P2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NELFAQ9H3P2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NELFAQ9H3P2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NELFAQ9H3P2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NELFAQ9H3P2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NELFAQ9H3P2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NELFAQ9H3P2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NELFAQ9H3P2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NELFAQ9H3P2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NELFAQ9H3P2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NELFAQ9H3P2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NELFAQ9H3P2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NELFAQ9H3P2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NELFAQ9H3P2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NELFAQ9H3P2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NELFAQ9H3P2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NELFAQ9H3P2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NELFAQ9H3P2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NELFAQ9H3P2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NELFAQ9H3P2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NELFAQ9H3P2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NELFAQ9H3P2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NELFAQ9H3P2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NELFAQ9H3P2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NELFAQ9H3P2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NELFAQ9H3P2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NELFAQ9H3P2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NELFAQ9H3P2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NELFAQ9H3P2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NELFAQ9H3P2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NELFAQ9H3P2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NELFAQ9H3P2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NELFAQ9H3P2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NELFAQ9H3P2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NELFAQ9H3P2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NELFAQ9H3P2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NELFAQ9H3P2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NELFAQ9H3P2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NELFAQ9H3P2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NELFAQ9H3P2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NELFAQ9H3P2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NELFAQ9H3P2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NELFAQ9H3P2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NELFAQ9H3P2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NELFAQ9H3P2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NELFAQ9H3P2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NELFAQ9H3P2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NELFAQ9H3P2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NELFAQ9H3P2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NELFAQ9H3P2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NELFAQ9H3P2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NELFAQ9H3P2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NELFAQ9H3P2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NELFAQ9H3P2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NELFAQ9H3P2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NELFAQ9H3P2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NELFAQ9H3P2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NELFAQ9H3P2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NELFAQ9H3P2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NELFAQ9H3P2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NELFAQ9H3P2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NELFAQ9H3P2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NELFAQ9H3P2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NELFAQ9H3P2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NELFAQ9H3P2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NELFAQ9H3P2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NELFAQ9H3P2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NELFAQ9H3P2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NELFAQ9H3P2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NELFAQ9H3P2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NELFAQ9H3P2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NELFAQ9H3P2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NELFAQ9H3P2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NELFAQ9H3P2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NELFAQ9H3P2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NELFAQ9H3P2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NELFAQ9H3P2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NELFAQ9H3P2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NELFAQ9H3P2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NELFAQ9H3P2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NELFAQ9H3P2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NELFAQ9H3P2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NELFAQ9H3P2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NELFAQ9H3P2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NELFAQ9H3P2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NELFAQ9H3P2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NELFAQ9H3P2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NELFAQ9H3P2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NELFAQ9H3P2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NELFAQ9H3P2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NELFAQ9H3P2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms