Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3K2

GHITM, Growth hormone-inducible transmembrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GHITMQ9H3K2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GHITMQ9H3K2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GHITMQ9H3K2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GHITMQ9H3K2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GHITMQ9H3K2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GHITMQ9H3K2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GHITMQ9H3K2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GHITMQ9H3K2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GHITMQ9H3K2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GHITMQ9H3K2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GHITMQ9H3K2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GHITMQ9H3K2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GHITMQ9H3K2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GHITMQ9H3K2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GHITMQ9H3K2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GHITMQ9H3K2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GHITMQ9H3K2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GHITMQ9H3K2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GHITMQ9H3K2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GHITMQ9H3K2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GHITMQ9H3K2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GHITMQ9H3K2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GHITMQ9H3K2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GHITMQ9H3K2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GHITMQ9H3K2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GHITMQ9H3K2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GHITMQ9H3K2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GHITMQ9H3K2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GHITMQ9H3K2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GHITMQ9H3K2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GHITMQ9H3K2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GHITMQ9H3K2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GHITMQ9H3K2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GHITMQ9H3K2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GHITMQ9H3K2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GHITMQ9H3K2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GHITMQ9H3K2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GHITMQ9H3K2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GHITMQ9H3K2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GHITMQ9H3K2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GHITMQ9H3K2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GHITMQ9H3K2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GHITMQ9H3K2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GHITMQ9H3K2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GHITMQ9H3K2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GHITMQ9H3K2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GHITMQ9H3K2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GHITMQ9H3K2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GHITMQ9H3K2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GHITMQ9H3K2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GHITMQ9H3K2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GHITMQ9H3K2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GHITMQ9H3K2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GHITMQ9H3K2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GHITMQ9H3K2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GHITMQ9H3K2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GHITMQ9H3K2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GHITMQ9H3K2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GHITMQ9H3K2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GHITMQ9H3K2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GHITMQ9H3K2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GHITMQ9H3K2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GHITMQ9H3K2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GHITMQ9H3K2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GHITMQ9H3K2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GHITMQ9H3K2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GHITMQ9H3K2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GHITMQ9H3K2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GHITMQ9H3K2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GHITMQ9H3K2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GHITMQ9H3K2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms