Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3K2

GHITM, Growth hormone-inducible transmembrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GHITMQ9H3K2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GHITMQ9H3K2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GHITMQ9H3K2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GHITMQ9H3K2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GHITMQ9H3K2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GHITMQ9H3K2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GHITMQ9H3K2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GHITMQ9H3K2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GHITMQ9H3K2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GHITMQ9H3K2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
GHITMQ9H3K2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GHITMQ9H3K2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GHITMQ9H3K2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GHITMQ9H3K2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GHITMQ9H3K2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GHITMQ9H3K2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GHITMQ9H3K2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
GHITMQ9H3K2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GHITMQ9H3K2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GHITMQ9H3K2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GHITMQ9H3K2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GHITMQ9H3K2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GHITMQ9H3K2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GHITMQ9H3K2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GHITMQ9H3K2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GHITMQ9H3K2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GHITMQ9H3K2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GHITMQ9H3K2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GHITMQ9H3K2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GHITMQ9H3K2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GHITMQ9H3K2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GHITMQ9H3K2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GHITMQ9H3K2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GHITMQ9H3K2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GHITMQ9H3K2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GHITMQ9H3K2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GHITMQ9H3K2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GHITMQ9H3K2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GHITMQ9H3K2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GHITMQ9H3K2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GHITMQ9H3K2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GHITMQ9H3K2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GHITMQ9H3K2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GHITMQ9H3K2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GHITMQ9H3K2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GHITMQ9H3K2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GHITMQ9H3K2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GHITMQ9H3K2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GHITMQ9H3K2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GHITMQ9H3K2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GHITMQ9H3K2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GHITMQ9H3K2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GHITMQ9H3K2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GHITMQ9H3K2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GHITMQ9H3K2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GHITMQ9H3K2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GHITMQ9H3K2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GHITMQ9H3K2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GHITMQ9H3K2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GHITMQ9H3K2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GHITMQ9H3K2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GHITMQ9H3K2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GHITMQ9H3K2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GHITMQ9H3K2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GHITMQ9H3K2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GHITMQ9H3K2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GHITMQ9H3K2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GHITMQ9H3K2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GHITMQ9H3K2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GHITMQ9H3K2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GHITMQ9H3K2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GHITMQ9H3K2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GHITMQ9H3K2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GHITMQ9H3K2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GHITMQ9H3K2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GHITMQ9H3K2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GHITMQ9H3K2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GHITMQ9H3K2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GHITMQ9H3K2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GHITMQ9H3K2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GHITMQ9H3K2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GHITMQ9H3K2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GHITMQ9H3K2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GHITMQ9H3K2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GHITMQ9H3K2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GHITMQ9H3K2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GHITMQ9H3K2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GHITMQ9H3K2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GHITMQ9H3K2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GHITMQ9H3K2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GHITMQ9H3K2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GHITMQ9H3K2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GHITMQ9H3K2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GHITMQ9H3K2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GHITMQ9H3K2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GHITMQ9H3K2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GHITMQ9H3K2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GHITMQ9H3K2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GHITMQ9H3K2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GHITMQ9H3K2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms