Protein–RNA interactions for Protein: Q9C029

TRIM7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM7Q9C029 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM7Q9C029 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM7Q9C029 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM7Q9C029 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM7Q9C029 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM7Q9C029 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM7Q9C029 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM7Q9C029 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM7Q9C029 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM7Q9C029 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM7Q9C029 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM7Q9C029 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM7Q9C029 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM7Q9C029 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM7Q9C029 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM7Q9C029 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM7Q9C029 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM7Q9C029 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM7Q9C029 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM7Q9C029 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM7Q9C029 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM7Q9C029 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM7Q9C029 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM7Q9C029 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM7Q9C029 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM7Q9C029 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM7Q9C029 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM7Q9C029 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM7Q9C029 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM7Q9C029 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM7Q9C029 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM7Q9C029 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM7Q9C029 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM7Q9C029 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM7Q9C029 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM7Q9C029 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM7Q9C029 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM7Q9C029 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM7Q9C029 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM7Q9C029 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM7Q9C029 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM7Q9C029 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM7Q9C029 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM7Q9C029 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM7Q9C029 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM7Q9C029 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM7Q9C029 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM7Q9C029 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM7Q9C029 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM7Q9C029 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM7Q9C029 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM7Q9C029 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM7Q9C029 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM7Q9C029 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM7Q9C029 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM7Q9C029 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM7Q9C029 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM7Q9C029 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM7Q9C029 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM7Q9C029 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM7Q9C029 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM7Q9C029 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM7Q9C029 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM7Q9C029 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM7Q9C029 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM7Q9C029 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM7Q9C029 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM7Q9C029 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM7Q9C029 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM7Q9C029 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM7Q9C029 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM7Q9C029 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM7Q9C029 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TRIM7Q9C029 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM7Q9C029 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM7Q9C029 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM7Q9C029 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM7Q9C029 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM7Q9C029 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM7Q9C029 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM7Q9C029 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM7Q9C029 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM7Q9C029 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM7Q9C029 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM7Q9C029 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM7Q9C029 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM7Q9C029 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM7Q9C029 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM7Q9C029 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM7Q9C029 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM7Q9C029 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM7Q9C029 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM7Q9C029 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM7Q9C029 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM7Q9C029 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM7Q9C029 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM7Q9C029 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRIM7Q9C029 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM7Q9C029 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM7Q9C029 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms