Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC4A5Q9BY07 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC4A5Q9BY07 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC4A5Q9BY07 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC4A5Q9BY07 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC4A5Q9BY07 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC4A5Q9BY07 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC4A5Q9BY07 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC4A5Q9BY07 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC4A5Q9BY07 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC4A5Q9BY07 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC4A5Q9BY07 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC4A5Q9BY07 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC4A5Q9BY07 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC4A5Q9BY07 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC4A5Q9BY07 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC4A5Q9BY07 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC4A5Q9BY07 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC4A5Q9BY07 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC4A5Q9BY07 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC4A5Q9BY07 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC4A5Q9BY07 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC4A5Q9BY07 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC4A5Q9BY07 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC4A5Q9BY07 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC4A5Q9BY07 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC4A5Q9BY07 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC4A5Q9BY07 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC4A5Q9BY07 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC4A5Q9BY07 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC4A5Q9BY07 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC4A5Q9BY07 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC4A5Q9BY07 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC4A5Q9BY07 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC4A5Q9BY07 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLC4A5Q9BY07 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLC4A5Q9BY07 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC4A5Q9BY07 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC4A5Q9BY07 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC4A5Q9BY07 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC4A5Q9BY07 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC4A5Q9BY07 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC4A5Q9BY07 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC4A5Q9BY07 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC4A5Q9BY07 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC4A5Q9BY07 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC4A5Q9BY07 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A5Q9BY07 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A5Q9BY07 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A5Q9BY07 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A5Q9BY07 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A5Q9BY07 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC4A5Q9BY07 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC4A5Q9BY07 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC4A5Q9BY07 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC4A5Q9BY07 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC4A5Q9BY07 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC4A5Q9BY07 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC4A5Q9BY07 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC4A5Q9BY07 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC4A5Q9BY07 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC4A5Q9BY07 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC4A5Q9BY07 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC4A5Q9BY07 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC4A5Q9BY07 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC4A5Q9BY07 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC4A5Q9BY07 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC4A5Q9BY07 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC4A5Q9BY07 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC4A5Q9BY07 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC4A5Q9BY07 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A5Q9BY07 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A5Q9BY07 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A5Q9BY07 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A5Q9BY07 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC4A5Q9BY07 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC4A5Q9BY07 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SLC4A5Q9BY07 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SLC4A5Q9BY07 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC4A5Q9BY07 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC4A5Q9BY07 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC4A5Q9BY07 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC4A5Q9BY07 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC4A5Q9BY07 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC4A5Q9BY07 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC4A5Q9BY07 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC4A5Q9BY07 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC4A5Q9BY07 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC4A5Q9BY07 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC4A5Q9BY07 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC4A5Q9BY07 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC4A5Q9BY07 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC4A5Q9BY07 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SLC4A5Q9BY07 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC4A5Q9BY07 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC4A5Q9BY07 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC4A5Q9BY07 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC4A5Q9BY07 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC4A5Q9BY07 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC4A5Q9BY07 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms