Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY5

CAPS2, Calcyphosin-2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPS2Q9BXY5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAPS2Q9BXY5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAPS2Q9BXY5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAPS2Q9BXY5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAPS2Q9BXY5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CAPS2Q9BXY5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAPS2Q9BXY5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAPS2Q9BXY5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAPS2Q9BXY5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAPS2Q9BXY5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAPS2Q9BXY5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAPS2Q9BXY5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAPS2Q9BXY5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAPS2Q9BXY5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAPS2Q9BXY5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAPS2Q9BXY5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CAPS2Q9BXY5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CAPS2Q9BXY5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CAPS2Q9BXY5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CAPS2Q9BXY5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CAPS2Q9BXY5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAPS2Q9BXY5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAPS2Q9BXY5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAPS2Q9BXY5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAPS2Q9BXY5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAPS2Q9BXY5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAPS2Q9BXY5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAPS2Q9BXY5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAPS2Q9BXY5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAPS2Q9BXY5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPS2Q9BXY5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPS2Q9BXY5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPS2Q9BXY5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPS2Q9BXY5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPS2Q9BXY5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPS2Q9BXY5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAPS2Q9BXY5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAPS2Q9BXY5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CAPS2Q9BXY5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAPS2Q9BXY5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CAPS2Q9BXY5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPS2Q9BXY5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPS2Q9BXY5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPS2Q9BXY5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPS2Q9BXY5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPS2Q9BXY5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPS2Q9BXY5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPS2Q9BXY5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPS2Q9BXY5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPS2Q9BXY5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAPS2Q9BXY5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAPS2Q9BXY5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAPS2Q9BXY5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAPS2Q9BXY5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAPS2Q9BXY5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAPS2Q9BXY5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAPS2Q9BXY5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAPS2Q9BXY5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAPS2Q9BXY5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CAPS2Q9BXY5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAPS2Q9BXY5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAPS2Q9BXY5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CAPS2Q9BXY5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAPS2Q9BXY5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAPS2Q9BXY5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAPS2Q9BXY5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAPS2Q9BXY5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAPS2Q9BXY5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAPS2Q9BXY5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPS2Q9BXY5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPS2Q9BXY5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAPS2Q9BXY5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAPS2Q9BXY5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAPS2Q9BXY5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAPS2Q9BXY5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAPS2Q9BXY5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAPS2Q9BXY5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAPS2Q9BXY5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAPS2Q9BXY5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPS2Q9BXY5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPS2Q9BXY5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAPS2Q9BXY5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAPS2Q9BXY5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAPS2Q9BXY5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAPS2Q9BXY5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CAPS2Q9BXY5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAPS2Q9BXY5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAPS2Q9BXY5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAPS2Q9BXY5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAPS2Q9BXY5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAPS2Q9BXY5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPS2Q9BXY5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPS2Q9BXY5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPS2Q9BXY5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPS2Q9BXY5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPS2Q9BXY5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPS2Q9BXY5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPS2Q9BXY5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAPS2Q9BXY5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAPS2Q9BXY5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms