Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAMP8Q9BV40 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAMP8Q9BV40 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAMP8Q9BV40 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAMP8Q9BV40 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAMP8Q9BV40 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAMP8Q9BV40 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VAMP8Q9BV40 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VAMP8Q9BV40 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAMP8Q9BV40 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAMP8Q9BV40 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAMP8Q9BV40 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAMP8Q9BV40 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAMP8Q9BV40 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAMP8Q9BV40 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAMP8Q9BV40 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAMP8Q9BV40 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAMP8Q9BV40 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAMP8Q9BV40 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAMP8Q9BV40 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAMP8Q9BV40 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAMP8Q9BV40 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAMP8Q9BV40 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAMP8Q9BV40 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAMP8Q9BV40 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VAMP8Q9BV40 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
VAMP8Q9BV40 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VAMP8Q9BV40 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VAMP8Q9BV40 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VAMP8Q9BV40 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VAMP8Q9BV40 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
VAMP8Q9BV40 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VAMP8Q9BV40 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VAMP8Q9BV40 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VAMP8Q9BV40 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VAMP8Q9BV40 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VAMP8Q9BV40 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
VAMP8Q9BV40 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VAMP8Q9BV40 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VAMP8Q9BV40 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VAMP8Q9BV40 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
VAMP8Q9BV40 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
VAMP8Q9BV40 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VAMP8Q9BV40 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VAMP8Q9BV40 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VAMP8Q9BV40 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
VAMP8Q9BV40 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
VAMP8Q9BV40 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VAMP8Q9BV40 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VAMP8Q9BV40 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VAMP8Q9BV40 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VAMP8Q9BV40 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VAMP8Q9BV40 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAMP8Q9BV40 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAMP8Q9BV40 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAMP8Q9BV40 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAMP8Q9BV40 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAMP8Q9BV40 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAMP8Q9BV40 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAMP8Q9BV40 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAMP8Q9BV40 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAMP8Q9BV40 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAMP8Q9BV40 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAMP8Q9BV40 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAMP8Q9BV40 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAMP8Q9BV40 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAMP8Q9BV40 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAMP8Q9BV40 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAMP8Q9BV40 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAMP8Q9BV40 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAMP8Q9BV40 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAMP8Q9BV40 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAMP8Q9BV40 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAMP8Q9BV40 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAMP8Q9BV40 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAMP8Q9BV40 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAMP8Q9BV40 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
VAMP8Q9BV40 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VAMP8Q9BV40 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
VAMP8Q9BV40 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VAMP8Q9BV40 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAMP8Q9BV40 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAMP8Q9BV40 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAMP8Q9BV40 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAMP8Q9BV40 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAMP8Q9BV40 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAMP8Q9BV40 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAMP8Q9BV40 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAMP8Q9BV40 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAMP8Q9BV40 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAMP8Q9BV40 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAMP8Q9BV40 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
VAMP8Q9BV40 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAMP8Q9BV40 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAMP8Q9BV40 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAMP8Q9BV40 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAMP8Q9BV40 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAMP8Q9BV40 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAMP8Q9BV40 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAMP8Q9BV40 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms