Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBB6Q9BUF5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBB6Q9BUF5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBB6Q9BUF5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBB6Q9BUF5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBB6Q9BUF5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUBB6Q9BUF5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUBB6Q9BUF5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TUBB6Q9BUF5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TUBB6Q9BUF5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBB6Q9BUF5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBB6Q9BUF5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBB6Q9BUF5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBB6Q9BUF5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBB6Q9BUF5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUBB6Q9BUF5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUBB6Q9BUF5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TUBB6Q9BUF5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBB6Q9BUF5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBB6Q9BUF5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBB6Q9BUF5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBB6Q9BUF5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBB6Q9BUF5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBB6Q9BUF5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBB6Q9BUF5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBB6Q9BUF5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBB6Q9BUF5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBB6Q9BUF5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBB6Q9BUF5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBB6Q9BUF5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBB6Q9BUF5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBB6Q9BUF5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBB6Q9BUF5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBB6Q9BUF5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBB6Q9BUF5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBB6Q9BUF5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBB6Q9BUF5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBB6Q9BUF5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBB6Q9BUF5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBB6Q9BUF5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBB6Q9BUF5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBB6Q9BUF5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBB6Q9BUF5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBB6Q9BUF5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBB6Q9BUF5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBB6Q9BUF5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBB6Q9BUF5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBB6Q9BUF5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBB6Q9BUF5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBB6Q9BUF5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBB6Q9BUF5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBB6Q9BUF5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBB6Q9BUF5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBB6Q9BUF5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBB6Q9BUF5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBB6Q9BUF5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBB6Q9BUF5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBB6Q9BUF5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBB6Q9BUF5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBB6Q9BUF5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBB6Q9BUF5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBB6Q9BUF5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBB6Q9BUF5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBB6Q9BUF5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBB6Q9BUF5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBB6Q9BUF5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBB6Q9BUF5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBB6Q9BUF5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBB6Q9BUF5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBB6Q9BUF5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBB6Q9BUF5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBB6Q9BUF5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBB6Q9BUF5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBB6Q9BUF5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBB6Q9BUF5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBB6Q9BUF5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBB6Q9BUF5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBB6Q9BUF5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBB6Q9BUF5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBB6Q9BUF5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBB6Q9BUF5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBB6Q9BUF5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBB6Q9BUF5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBB6Q9BUF5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBB6Q9BUF5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBB6Q9BUF5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBB6Q9BUF5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBB6Q9BUF5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBB6Q9BUF5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBB6Q9BUF5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBB6Q9BUF5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBB6Q9BUF5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBB6Q9BUF5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBB6Q9BUF5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBB6Q9BUF5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBB6Q9BUF5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TUBB6Q9BUF5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBB6Q9BUF5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBB6Q9BUF5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBB6Q9BUF5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms