Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPOQ9BU64 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPOQ9BU64 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPOQ9BU64 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPOQ9BU64 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPOQ9BU64 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPOQ9BU64 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPOQ9BU64 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPOQ9BU64 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPOQ9BU64 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPOQ9BU64 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPOQ9BU64 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPOQ9BU64 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPOQ9BU64 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPOQ9BU64 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPOQ9BU64 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPOQ9BU64 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPOQ9BU64 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPOQ9BU64 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPOQ9BU64 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPOQ9BU64 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPOQ9BU64 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPOQ9BU64 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPOQ9BU64 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPOQ9BU64 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPOQ9BU64 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPOQ9BU64 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPOQ9BU64 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPOQ9BU64 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPOQ9BU64 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPOQ9BU64 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPOQ9BU64 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPOQ9BU64 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPOQ9BU64 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPOQ9BU64 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPOQ9BU64 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CENPOQ9BU64 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPOQ9BU64 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPOQ9BU64 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPOQ9BU64 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPOQ9BU64 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPOQ9BU64 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPOQ9BU64 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPOQ9BU64 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPOQ9BU64 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPOQ9BU64 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPOQ9BU64 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPOQ9BU64 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPOQ9BU64 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPOQ9BU64 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPOQ9BU64 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPOQ9BU64 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPOQ9BU64 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPOQ9BU64 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPOQ9BU64 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPOQ9BU64 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPOQ9BU64 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPOQ9BU64 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPOQ9BU64 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPOQ9BU64 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPOQ9BU64 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPOQ9BU64 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPOQ9BU64 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPOQ9BU64 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPOQ9BU64 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPOQ9BU64 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPOQ9BU64 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPOQ9BU64 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPOQ9BU64 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPOQ9BU64 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPOQ9BU64 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPOQ9BU64 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPOQ9BU64 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPOQ9BU64 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPOQ9BU64 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPOQ9BU64 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPOQ9BU64 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPOQ9BU64 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPOQ9BU64 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPOQ9BU64 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPOQ9BU64 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPOQ9BU64 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPOQ9BU64 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPOQ9BU64 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPOQ9BU64 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPOQ9BU64 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPOQ9BU64 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPOQ9BU64 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPOQ9BU64 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CENPOQ9BU64 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPOQ9BU64 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPOQ9BU64 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPOQ9BU64 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPOQ9BU64 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPOQ9BU64 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPOQ9BU64 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPOQ9BU64 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPOQ9BU64 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPOQ9BU64 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPOQ9BU64 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms