Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPS4Q9BT78 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPS4Q9BT78 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPS4Q9BT78 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPS4Q9BT78 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPS4Q9BT78 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPS4Q9BT78 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPS4Q9BT78 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COPS4Q9BT78 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPS4Q9BT78 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPS4Q9BT78 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COPS4Q9BT78 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPS4Q9BT78 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
COPS4Q9BT78 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPS4Q9BT78 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPS4Q9BT78 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPS4Q9BT78 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPS4Q9BT78 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPS4Q9BT78 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPS4Q9BT78 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPS4Q9BT78 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COPS4Q9BT78 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
COPS4Q9BT78 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPS4Q9BT78 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPS4Q9BT78 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPS4Q9BT78 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPS4Q9BT78 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPS4Q9BT78 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPS4Q9BT78 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
COPS4Q9BT78 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPS4Q9BT78 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPS4Q9BT78 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPS4Q9BT78 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPS4Q9BT78 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPS4Q9BT78 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPS4Q9BT78 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPS4Q9BT78 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPS4Q9BT78 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COPS4Q9BT78 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COPS4Q9BT78 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COPS4Q9BT78 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COPS4Q9BT78 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COPS4Q9BT78 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COPS4Q9BT78 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COPS4Q9BT78 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COPS4Q9BT78 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COPS4Q9BT78 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COPS4Q9BT78 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COPS4Q9BT78 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPS4Q9BT78 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPS4Q9BT78 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPS4Q9BT78 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPS4Q9BT78 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COPS4Q9BT78 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COPS4Q9BT78 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COPS4Q9BT78 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COPS4Q9BT78 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COPS4Q9BT78 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COPS4Q9BT78 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COPS4Q9BT78 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COPS4Q9BT78 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COPS4Q9BT78 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COPS4Q9BT78 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COPS4Q9BT78 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COPS4Q9BT78 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COPS4Q9BT78 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COPS4Q9BT78 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPS4Q9BT78 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPS4Q9BT78 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPS4Q9BT78 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPS4Q9BT78 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPS4Q9BT78 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPS4Q9BT78 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPS4Q9BT78 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COPS4Q9BT78 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COPS4Q9BT78 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COPS4Q9BT78 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COPS4Q9BT78 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPS4Q9BT78 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
COPS4Q9BT78 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPS4Q9BT78 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPS4Q9BT78 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPS4Q9BT78 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
COPS4Q9BT78 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPS4Q9BT78 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPS4Q9BT78 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPS4Q9BT78 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPS4Q9BT78 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPS4Q9BT78 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPS4Q9BT78 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPS4Q9BT78 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPS4Q9BT78 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPS4Q9BT78 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPS4Q9BT78 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPS4Q9BT78 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPS4Q9BT78 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPS4Q9BT78 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPS4Q9BT78 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPS4Q9BT78 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPS4Q9BT78 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms