Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBA1CQ9BQE3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBA1CQ9BQE3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBA1CQ9BQE3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBA1CQ9BQE3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBA1CQ9BQE3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBA1CQ9BQE3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBA1CQ9BQE3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBA1CQ9BQE3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBA1CQ9BQE3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBA1CQ9BQE3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBA1CQ9BQE3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBA1CQ9BQE3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBA1CQ9BQE3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBA1CQ9BQE3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBA1CQ9BQE3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBA1CQ9BQE3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBA1CQ9BQE3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBA1CQ9BQE3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBA1CQ9BQE3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBA1CQ9BQE3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBA1CQ9BQE3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBA1CQ9BQE3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBA1CQ9BQE3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBA1CQ9BQE3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBA1CQ9BQE3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBA1CQ9BQE3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBA1CQ9BQE3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBA1CQ9BQE3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBA1CQ9BQE3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBA1CQ9BQE3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBA1CQ9BQE3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBA1CQ9BQE3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBA1CQ9BQE3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBA1CQ9BQE3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBA1CQ9BQE3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBA1CQ9BQE3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBA1CQ9BQE3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBA1CQ9BQE3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBA1CQ9BQE3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBA1CQ9BQE3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBA1CQ9BQE3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBA1CQ9BQE3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBA1CQ9BQE3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBA1CQ9BQE3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBA1CQ9BQE3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBA1CQ9BQE3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBA1CQ9BQE3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBA1CQ9BQE3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBA1CQ9BQE3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBA1CQ9BQE3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBA1CQ9BQE3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBA1CQ9BQE3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBA1CQ9BQE3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBA1CQ9BQE3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBA1CQ9BQE3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBA1CQ9BQE3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBA1CQ9BQE3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBA1CQ9BQE3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBA1CQ9BQE3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBA1CQ9BQE3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBA1CQ9BQE3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBA1CQ9BQE3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TUBA1CQ9BQE3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TUBA1CQ9BQE3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBA1CQ9BQE3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBA1CQ9BQE3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBA1CQ9BQE3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBA1CQ9BQE3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBA1CQ9BQE3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBA1CQ9BQE3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBA1CQ9BQE3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBA1CQ9BQE3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBA1CQ9BQE3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBA1CQ9BQE3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBA1CQ9BQE3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBA1CQ9BQE3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBA1CQ9BQE3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBA1CQ9BQE3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBA1CQ9BQE3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBA1CQ9BQE3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBA1CQ9BQE3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBA1CQ9BQE3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TUBA1CQ9BQE3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TUBA1CQ9BQE3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TUBA1CQ9BQE3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TUBA1CQ9BQE3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBA1CQ9BQE3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBA1CQ9BQE3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBA1CQ9BQE3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBA1CQ9BQE3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBA1CQ9BQE3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBA1CQ9BQE3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBA1CQ9BQE3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBA1CQ9BQE3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBA1CQ9BQE3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBA1CQ9BQE3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBA1CQ9BQE3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBA1CQ9BQE3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBA1CQ9BQE3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms