Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ15

NABP2, SOSS complex subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NABP2Q9BQ15 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NABP2Q9BQ15 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NABP2Q9BQ15 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NABP2Q9BQ15 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NABP2Q9BQ15 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NABP2Q9BQ15 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NABP2Q9BQ15 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NABP2Q9BQ15 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NABP2Q9BQ15 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
NABP2Q9BQ15 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NABP2Q9BQ15 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NABP2Q9BQ15 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NABP2Q9BQ15 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NABP2Q9BQ15 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NABP2Q9BQ15 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NABP2Q9BQ15 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NABP2Q9BQ15 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
NABP2Q9BQ15 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NABP2Q9BQ15 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NABP2Q9BQ15 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NABP2Q9BQ15 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NABP2Q9BQ15 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NABP2Q9BQ15 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
NABP2Q9BQ15 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NABP2Q9BQ15 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NABP2Q9BQ15 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NABP2Q9BQ15 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NABP2Q9BQ15 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NABP2Q9BQ15 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NABP2Q9BQ15 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NABP2Q9BQ15 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NABP2Q9BQ15 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NABP2Q9BQ15 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NABP2Q9BQ15 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NABP2Q9BQ15 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NABP2Q9BQ15 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NABP2Q9BQ15 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NABP2Q9BQ15 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NABP2Q9BQ15 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NABP2Q9BQ15 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NABP2Q9BQ15 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NABP2Q9BQ15 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NABP2Q9BQ15 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NABP2Q9BQ15 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NABP2Q9BQ15 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NABP2Q9BQ15 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NABP2Q9BQ15 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NABP2Q9BQ15 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NABP2Q9BQ15 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NABP2Q9BQ15 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NABP2Q9BQ15 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NABP2Q9BQ15 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NABP2Q9BQ15 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NABP2Q9BQ15 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NABP2Q9BQ15 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NABP2Q9BQ15 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NABP2Q9BQ15 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NABP2Q9BQ15 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NABP2Q9BQ15 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NABP2Q9BQ15 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NABP2Q9BQ15 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NABP2Q9BQ15 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NABP2Q9BQ15 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NABP2Q9BQ15 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NABP2Q9BQ15 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NABP2Q9BQ15 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NABP2Q9BQ15 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NABP2Q9BQ15 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NABP2Q9BQ15 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NABP2Q9BQ15 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NABP2Q9BQ15 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NABP2Q9BQ15 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NABP2Q9BQ15 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NABP2Q9BQ15 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NABP2Q9BQ15 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NABP2Q9BQ15 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NABP2Q9BQ15 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NABP2Q9BQ15 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NABP2Q9BQ15 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NABP2Q9BQ15 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NABP2Q9BQ15 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NABP2Q9BQ15 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NABP2Q9BQ15 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NABP2Q9BQ15 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NABP2Q9BQ15 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NABP2Q9BQ15 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NABP2Q9BQ15 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NABP2Q9BQ15 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NABP2Q9BQ15 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NABP2Q9BQ15 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NABP2Q9BQ15 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NABP2Q9BQ15 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NABP2Q9BQ15 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NABP2Q9BQ15 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NABP2Q9BQ15 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NABP2Q9BQ15 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NABP2Q9BQ15 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NABP2Q9BQ15 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NABP2Q9BQ15 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NABP2Q9BQ15 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms