Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SH3GL2Q99962 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SH3GL2Q99962 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SH3GL2Q99962 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SH3GL2Q99962 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SH3GL2Q99962 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SH3GL2Q99962 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SH3GL2Q99962 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SH3GL2Q99962 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SH3GL2Q99962 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SH3GL2Q99962 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SH3GL2Q99962 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SH3GL2Q99962 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SH3GL2Q99962 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SH3GL2Q99962 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SH3GL2Q99962 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SH3GL2Q99962 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SH3GL2Q99962 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SH3GL2Q99962 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SH3GL2Q99962 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SH3GL2Q99962 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SH3GL2Q99962 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SH3GL2Q99962 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SH3GL2Q99962 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SH3GL2Q99962 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SH3GL2Q99962 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SH3GL2Q99962 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SH3GL2Q99962 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SH3GL2Q99962 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SH3GL2Q99962 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SH3GL2Q99962 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SH3GL2Q99962 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SH3GL2Q99962 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SH3GL2Q99962 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SH3GL2Q99962 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SH3GL2Q99962 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SH3GL2Q99962 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH3GL2Q99962 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH3GL2Q99962 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH3GL2Q99962 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH3GL2Q99962 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH3GL2Q99962 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH3GL2Q99962 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH3GL2Q99962 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SH3GL2Q99962 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SH3GL2Q99962 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SH3GL2Q99962 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SH3GL2Q99962 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SH3GL2Q99962 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SH3GL2Q99962 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SH3GL2Q99962 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SH3GL2Q99962 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SH3GL2Q99962 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SH3GL2Q99962 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SH3GL2Q99962 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SH3GL2Q99962 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH3GL2Q99962 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH3GL2Q99962 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH3GL2Q99962 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH3GL2Q99962 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SH3GL2Q99962 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SH3GL2Q99962 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SH3GL2Q99962 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SH3GL2Q99962 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SH3GL2Q99962 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SH3GL2Q99962 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SH3GL2Q99962 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SH3GL2Q99962 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SH3GL2Q99962 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SH3GL2Q99962 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SH3GL2Q99962 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SH3GL2Q99962 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SH3GL2Q99962 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SH3GL2Q99962 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SH3GL2Q99962 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SH3GL2Q99962 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SH3GL2Q99962 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SH3GL2Q99962 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SH3GL2Q99962 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SH3GL2Q99962 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SH3GL2Q99962 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SH3GL2Q99962 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SH3GL2Q99962 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SH3GL2Q99962 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SH3GL2Q99962 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SH3GL2Q99962 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SH3GL2Q99962 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SH3GL2Q99962 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SH3GL2Q99962 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SH3GL2Q99962 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SH3GL2Q99962 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SH3GL2Q99962 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SH3GL2Q99962 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SH3GL2Q99962 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SH3GL2Q99962 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SH3GL2Q99962 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SH3GL2Q99962 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SH3GL2Q99962 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SH3GL2Q99962 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SH3GL2Q99962 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms