Protein–RNA interactions for Protein: Q99742

NPAS1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1Q99742 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NPAS1Q99742 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NPAS1Q99742 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NPAS1Q99742 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NPAS1Q99742 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPAS1Q99742 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPAS1Q99742 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NPAS1Q99742 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPAS1Q99742 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPAS1Q99742 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPAS1Q99742 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPAS1Q99742 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPAS1Q99742 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPAS1Q99742 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPAS1Q99742 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPAS1Q99742 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPAS1Q99742 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPAS1Q99742 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPAS1Q99742 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPAS1Q99742 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPAS1Q99742 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPAS1Q99742 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPAS1Q99742 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPAS1Q99742 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPAS1Q99742 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPAS1Q99742 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPAS1Q99742 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPAS1Q99742 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPAS1Q99742 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPAS1Q99742 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPAS1Q99742 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPAS1Q99742 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPAS1Q99742 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPAS1Q99742 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPAS1Q99742 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPAS1Q99742 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPAS1Q99742 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPAS1Q99742 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPAS1Q99742 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPAS1Q99742 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NPAS1Q99742 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPAS1Q99742 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NPAS1Q99742 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NPAS1Q99742 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NPAS1Q99742 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPAS1Q99742 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPAS1Q99742 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPAS1Q99742 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPAS1Q99742 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NPAS1Q99742 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPAS1Q99742 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPAS1Q99742 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPAS1Q99742 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPAS1Q99742 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NPAS1Q99742 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NPAS1Q99742 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NPAS1Q99742 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NPAS1Q99742 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPAS1Q99742 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPAS1Q99742 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPAS1Q99742 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPAS1Q99742 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NPAS1Q99742 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NPAS1Q99742 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NPAS1Q99742 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NPAS1Q99742 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NPAS1Q99742 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NPAS1Q99742 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NPAS1Q99742 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NPAS1Q99742 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NPAS1Q99742 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NPAS1Q99742 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPAS1Q99742 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPAS1Q99742 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NPAS1Q99742 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPAS1Q99742 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPAS1Q99742 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPAS1Q99742 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPAS1Q99742 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPAS1Q99742 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPAS1Q99742 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPAS1Q99742 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPAS1Q99742 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPAS1Q99742 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPAS1Q99742 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPAS1Q99742 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPAS1Q99742 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPAS1Q99742 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPAS1Q99742 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPAS1Q99742 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPAS1Q99742 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPAS1Q99742 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPAS1Q99742 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPAS1Q99742 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPAS1Q99742 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPAS1Q99742 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPAS1Q99742 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NPAS1Q99742 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPAS1Q99742 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPAS1Q99742 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms